Knox, 1826'dan 1840'a kadar Edinburgh'daki Surgeon's Square'de Barclay'in anatomi okulunu yönetti. İskoçya'daki en popüler anatomi hocasıydı, ancak sınıfında her zaman diseksiyon yapacak ceset sıkıntısı çekiyordu.
1832'deki Anatomi Yasası'nın arzı genişletmesinden önce, Birleşik Krallık'ta anatomik amaçlar için tek yasal ceset arzı, mahkemeler tarafından ölüme ve diseksiyona mahkum edilenlerdi. Bu da diseksiyon için meşru denek sıkıntısına yol açıyordu. Tıp öğrencilerini eğitme ihtiyacı arttıkça ve idamların sayısı azaldıkça bu eksiklik daha ciddi bir hal aldı.
Knox, okulunda bu sorunla en başından beri karşı karşıyaydı, çünkü 1815'ten sonra Kraliyet Kolejleri tıp müfredatında anatomi çalışmalarını artırmıştı. Eğer 'Fransız yöntemi' olarak bilinen yönteme göre ders verseydi, öğrenci başına bir ceset düşmesi gerekecekti. Sonuç olarak, ceset hırsızlığı o kadar yaygınlaştı ki, yeni ölmüş birinin akrabalarının ve arkadaşlarının, cesedin çalınmasını önlemek için gömülmeden önce ve sonra cesedin başında nöbet tutması alışılmadık bir durum değildi.
Kasım 1827'de William Hare, borçlu bir kiracısının tesadüfen ölmesiyle yeni bir kariyere başladı. Cesedi Knox'a teslim etmesi karşılığında kendisine 7.10/- £ (yedi pound ve on şilin) ödenmiştir. Artık Burke ve suç ortağı Hare düzenli olarak serserileri ve sarhoşları öldürmeye başladılar. West Port Cinayetleri olarak bilinen 16 cinayetten sonra, 2 Kasım 1828'de Burke ve Hare yakalandı. Tüm şehir, Burke ve Hare'in korkunç eylemleri karşısında baladlar, broşürler ve gazeteler tarafından beslenen dehşetle sarsıldı. Hare, King'in kanıtlarını teslim etti ve Burke asıldı, parçalara ayrıldı ve sergilendi.
Burke kasap, Hare hırsız,
Knox, et satın alan çocuk!
Knox'un yargılanmaması Edinburgh'da pek çok kişiyi öfkelendirdi. Evi bir güruh tarafından saldırıya uğradı ve camları kırıldı. Edinburgh Kraliyet Cemiyeti'nin bir komitesi onu suçsuz buldu, ancak davadaki rolü unutulmadı ve pek çok kişi ona karşı temkinli davrandı.
