Joseph Kony (okunuşu IPA: [koɲ]; d. 1961) Ugandalı bir gerilla grubu lideridir. Lord'un Direniş Ordusu'nun (LRA) başıdır. Halktan büyük destek görmesine rağmen, LRA destekçilerine karşı cephe almıştır. Bunu Acholi halkını "arındırmak" ve Uganda'yı On Emir ile yönetilen bir teokrasiye dönüştürmek için yaptıklarını söylediler.

LRA sivillere yaptığı çok kötü şeylerle biliniyor. Bunlardan ikisi cinayet ve tecavüzdür.

LRA, birçok ülkenin halkına karşı yaptıklarıyla tanınır hale gelmiştir. Bu ülkelerden bazıları Kuzey Uganda, Demokratik Kongo Cumhuriyeti, Orta Afrika Cumhuriyeti, Güney Sudan ve Sudan'dır. Yaklaşık 66,000 çocuğu çalmış ve kendileri için savaşmaya zorlamıştır.

Kony, 2005 yılında Hollanda'nın Lahey kentindeki Uluslararası Ceza Mahkemesi tarafından savaş suçu işlemekle itham edildi. Kendisi henüz yakalanmamıştır.