MÖ 3600'lere gelindiğinde, Nil Nehri üzerindeki neolitik Mısır toplumları ekin yetiştiriyor ve hayvanlarla tarım yapıyordu. MÖ 3600'den kısa bir süre sonra Mısır toplumu hızla büyümeye ve ilerlemeye başladı. Yeni bir tarzda çanak çömlek yaptılar ve bakır kullanmaya başladılar. Mısırlılar inşaat için güneşte kurutulmuş tuğla kullanmaya başladılar. Ayrıca dekoratif etki için kemer ve girintili duvarlar kullanmaya başladılar.
Yukarı Nil Nehri ya da Yukarı Mısır'daki toplumlar ve kentler bir araya gelmeye başladı. Bu durum Nil Deltası'nda ya da Aşağı Mısır'da da yaşanıyordu. Yukarı ve Aşağı Mısır arasında sık sık savaşlar oluyordu. Yukarı Mısır'daki yönetimi sırasında Kral Narmer Delta'daki düşmanlarını yendi. Yukarı ve Aşağı Mısır Krallığı'nı kendi yönetimi altında birleştirdi. Narmer resimlerde Yukarı Mısır'ın lotus çiçeği ve Aşağı Mısır'ın papirüs kamışı ile Pschent adı verilen çifte tacı takarken gösterilmiştir. Birleşik Mısır'ın bu sembolleri gelecekteki tüm hükümdarlar tarafından kullanılmıştır. Mitolojide, Aşağı Mısır'ın şahin-tanrısı Horus, Yukarı Mısır'ın tanrısı Seth'e karşı bir savaş kazanmıştır. Bu, Mısır krallarının tanrı ve ilahi olduğu fikrinin başlamasına yardımcı oldu ve bu fikir 3.000 yıl boyunca sürdü. Mısır hükümetinin temeli buydu. Nil toplumlarının birleşmesi Sahra'nın kurumasıyla da ilişkilendirilmiştir.
Zengin insanlar daha karmaşık cenaze uygulamalarına sahip olmaya başladı. Mısırlılar, Eski Krallık'ın Basamaklı piramidi gibi daha sonraki yapılara model olacak mastabalar inşa etmeye başladılar. Tahıl ürünlerinin yetiştirilmesi ve çiftlik işçilerini organize etmek için merkezi kontrolün kullanılması, sonraki 800 yıl boyunca devletin başarısına yardımcı oldu.
Mısır'ın, ilk kralının Memfis şehrinden hüküm sürmesinden çok önce kültürel ve ekonomik olarak birleşmiş olduğu kesin gibi görünüyor. Siyasi birleşme yavaş bir süreçti ve yaklaşık bir asır boyunca gerçekleşmişti. Yerel bölgeler ticaret ağları kurmaya başladı ve hükümetler tarım işçilerini büyük ölçekte örgütleyebildi. Horus, Seth ve Neith gibi tanrıların kültleri ülke çapında yayıldıkça ilahi krallık önem kazandı.
Mısır yazı sistemi daha da geliştirildi. Başlangıçta Mısır yazısı, çeşitli öğelerin miktarlarını gösteren birkaç semboldü. Üçüncü hanedanlığın sonuna gelindiğinde, hem fonogramlar hem de ideogramlar olmak üzere 200'den fazla sembole ulaşmıştı.
