Bionicle'ın 2001-2008 hikaye dizisi, yeraltındaki devasa kubbelerde var olan, ağırlıklı olarak yarı organik, yarı makine varlıkların yaşadığı bir bilim fantezi dünyasında geçiyordu. Bu dünya ("Matoran Evreni" olarak adlandırılır) ve ırkları, kötü Makuta Teridax ve Makuta Kardeşliği tarafından ebedi bir uykuya atılana kadar bir zamanlar Mata Nui adlı bir Büyük Ruh tarafından korunuyordu. Matoran dünyası parçalanmaya başladı. Ancak Mata Nui'nin içinde saklanan yaşam maskesi yeni bir gezegen bulmak için uzaya gönderildi. Maske Bara Magna gezegenine indi ve maske küçük bir beden yarattı.
2009 yılı, Mata Nui'nin Makuta Teridax tarafından sürgün edildikten sonra Bara Magna adlı gizemli ve çorak bir gezegene düşmesiyle, önceki yılları geride bırakıp yeni olasılıklara yelken açtığı yepyeni bir hikaye destanı başlattı. Burada hikayenin merkezi haline geliyor ve Matoran ile Toa'yı Makuta Teridax'ın zalim yönetiminden kurtarmanın bir yolunu bulmaya çalışırken yeni müttefikler ediniyor.
2001 - Maskelerin Peşinde
Hikaye altı Toa Mata ile başlıyor: Tahu, Lewa, Gali, Kopaka, Pohatu ve Onua, isimleri dışında hiçbir şey hatırlamadan Mata Nui Adası olarak bilinen bir adaya varırlar. Ada sakinleri olan Matoran köylülerinin, Makuta Teridax'ın güçlü etkisiyle Enfekte Kanohi maskeleri kullanılarak kontrol edilen ve yaklaşık 1000 yıl süren bir savaşa neden olan vahşi yaratıklar olan enfekte Rahi'nin sürekli saldırılarına maruz kaldıklarını keşfettiler. Çok sayıda Kanohi maskesi arayıp bulduktan sonra, Toa'ların her biri muazzam güce sahip bir Altın Kanohi maskesi alır ve Makuta'nın kendisini aramaya başlar. Vahşi Manas yengeçlerine ve Gölge Toa'ya (Toa'nın kötü doppelganger benzeri hayali kopyaları) meydan okuduktan sonra, Toa Makuta ile yüzleşir ve elemental güçlerini birleştirerek onu yener.
2002 - Bohrok Sürüleri
Yenilgisi üzerine Makuta kadim Bohrok'u serbest bıraktı. Bohrok, Mata Nui adasını "önceki zamanlardaki" haline "temizlemek" için tasarlanmış robotik dronlardır. Bohrok adadaki köyleri yakıp yıkmaya başladı ve Matoran'ı kaçmaya zorladı. Dünya'nın yaratıcı Matoranlarından biri olan Nuparu, sürülerle savaşmak için hasarlı bir Bohrok'un parçalarından Boxor adlı güçlü bir araç yapar. Bohrok'un amacından habersiz olan Toa, Bohrok Kraliçeleri Bahrag ile yüzleşmek için Bohrok'un Krana'sını (beyin işlevi gören maske benzeri yaratıklar) toplar: Cahdok ve Gahdok. Yenilen Cahdok ve Gahdok, Toa'nın elemental güçleri tarafından yaratılan bir hapishaneye kapatılır. Toa Mata daha sonra Energized Protodermis adlı bir maddeye maruz bırakılır ve bu madde onları dönüştürerek yeni zırhlar ve silahlar kazandırır. Kendilerine "Toa Nuva" adını verirler.
2003 - Bohrok-Kal Grevi ve Işık Maskesi
Cahdok ve Gahdok'un yenilmesiyle Bohrok Sürüleri durdurulur ve kovanlarına geri gönderilir. Ancak, Bohrok-Kal adı verilen altı yeni seçkin Bohrok, Bahrag'ı serbest bırakmak amacıyla ortaya çıktı. Daha sonra Toa Nuva'nın mührü kırmanın anahtarı olan güçlerini çalmaya başladılar. Yenilginin eşiğindeki Toa, tüm güçlerini Bohrok-Kal'a yükleyerek onları aşırı yükler ve yener.
Kısa bir süre sonra, iki Matoran, Takua ve Jaller, Kanohi Işık Maskesini keşfetti. Işığın Toa'sını bulmak için Mata Nui adası boyunca seyahat etmekle görevlendirildiler. Bu arada Makuta, maskeyi bulmaları ve Işığın Toa'sının gelişini durdurmaları için Rahkshi adı verilen altı yaratık yarattı ve gönderdi. Rahkshi, Mata Nui'yi boydan boya geçerek Ta-Koro ve Onu-Koro köylerini yok etti. Rahkshiler Toa tarafından durduruldu ama Jaller'ı öldürmeden önce değil. Jaller'in ölümü Takua'nın Işığın Toası olduğunu fark etmesine neden oldu ve maskeyi takarak Toa Takanuva oldu. Takanuva Makuta ile yüzleşmeye gitti ve savaşları sırasında her ikisi de bir varlığı değiştirme veya yok etme gücüne sahip gümüşi bir madde olan enerjili protodermis havuzuna düştüler ve Takutanuva olarak kaynaştılar. Takutanuva daha sonra Metru Nui şehrinin kapısını açarak Matoran ve Toa'nın geçmesine izin verdi. Yaşam enerjisinin bir kısmını kullanarak, kapıyı açık tutmaya devam ederken Jaller'ı canlandırdı. Bununla birlikte, enerji kullanımı çok büyüktü ve Takutanuva kapı tarafından ezildi, hem Takanuva'yı hem de Teridax'ı öldürür gibi göründü ve sadece Takanuva'nın Işık Maskesini bıraktı. Takanuva, maskesi Metru Nui'ye giden işaretçiyi etkinleştirmek için kullanıldığında derhal yeniden canlandırıldı. Daha sonra, Matoran ada şehri Metru Nui'ye dönmeye hazırlandı.
2004 - Metru Nui Efsaneleri
Matoran Metru Nui'ye yolculuk etmeye hazırlanırken, Turaga (köyün yaşlıları) bir zamanlar Toa olduklarını ve Metru Nui'de Morbuzakh bitki yaratığı ve Dume kontrolündeki Vahki infaz mangaları gibi tehditlere karşı savaştıklarını açıkladı. Onlar, Matoran olarak, Toa Lhikan tarafından kurban edilen güç içeren Toa taşları tarafından Toa Metru'ya dönüştürülmüşlerdir. Görevleri altı Büyük Diski bulmak ve şehri yok etmekle tehdit eden bir bitki tehdidi olan Morbuzakh'ı yenmekti. Ancak bunu başardıklarında, şehrin Turagası Dume tarafından ihanete uğradılar. Daha sonra, Makuta Teridax'ın Dume'un kılığına girdiğini ve Vahki'nin (kanun uygulayıcı robotlar) kontrolünü ele geçirdiğini keşfettiler. Planı, Matoranları uyutmak, hafızalarını silmek ve onları "fatihleri olarak" yeniden uyandırmaktı. Toa kaçtı ama Teridax tarafından saldırıya uğradı. Elemental güçlerini birleştirerek Teridax'ı kristalize protodermis hapishanesine kapatmayı başardılar. Toa, daha sonra Mata Nui olarak bilinecek olan yeni bir adaya gitti ve Matoran'ı kurtarmak için geri dönmeye yemin etti.
2005 - Gölgeler Ağı
Geri dönüyorlar. Ancak adada kötü kral Sidorak ve yardımcısı Roodaka, Visorak adı verilen örümcek benzeri yaratıklarla birlikte hüküm sürmektedir. Toa'lar kısa süre sonra yakalanır ve mutasyona uğrayarak vahşi Toa Hordika'ya dönüşürler. Toa normale dönmek için efsanevi Rahi Keetongu'yu aradı. Ancak Toa Vakama diğer Toa'lara ihanet ederek Sidorak'a katıldı ve onu Visorak'ın lideri yaptı. Diğer Toa'lar Visorak sürüsüyle büyük bir savaşta karşı karşıya geldi ve Vakama'yı kendilerine katılmaya ikna etti. Vakama daha sonra Visorakların serbest bırakılmasını emretti. Keetongu daha sonra Roodaka ve Vakama'nın ihanet ettiği Sidorak'ı öldürdü. Altı Toa daha sonra altı elemental güçleriyle Roodaka'yı yendi. Ancak bunun Makuta'yı serbest bırakma gibi bir yan etkisi oldu çünkü Roodaka onun hapishanesinin bir parçasını taşıyordu. Toa bu nedenle ona saldırdı. Keetongu tarafından eski haline getirilen Toa Metru, Matoran'ı yeni bir adaya getirdi. Matoran'ı uyandırmak için güçlerini feda ettiklerinde Turaga oldular ve daha sonra Mata Nui adı verilen bu adada yeni köyler kurdular.
2006 - Kıyamet Adası
Toa Nuva, Mata Nui'nin sadece uyumakla kalmayıp ölmekte olduğunu öğrendi. Onu kurtarmak için Voya Nui adasına gitmeleri ve gizemli Kanohi Ignika'yı, Yaşam Maskesini aramaları gerekmektedir. Toa Nuva bu maceraya atılır ancak kısa sürede altı yeni ve güçlü düşman olan Piraka tarafından esir alınır: Zaktann, Hakann, Vezok, Thok, Reidak ve Avak. Maskeyi kendi karanlık amaçları için arıyorlardı. Toa geri dönmeyince, altı Matoran'dan oluşan bir grup peşlerine düştü. Jaller, Hahli, Hewkii, Nuparu, Kongu ve Matoro Toa kutuları içinde adaya kaçtılar ama yolculukları sırasında Kızıl Yıldız'dan gelen ışık huzmeleri onları Toa Inika'ya dönüştürdü. Adaya vardıklarında Piraka'yı ve Matoran'a bir kale inşa ettirmek için sahte Toa kılığına girerek yerel Matoran'ı nasıl köleleştirdiklerini öğrenirler. Küçük bir Matoran Direnişi ve kadim koruyucu Axonn'un yardımıyla Toa Inika, Toa Nuva'yı serbest bırakmayı, maskenin tapınağını bulmayı ve Piraka'nın yanı sıra onu koruyan diğer yaratıklarla savaşmayı başardı. Sonunda Kanohi ile birlikte galip geldiler. Ancak Yaşam Maskesi'nin kendine ait bir iradesi vardı ve son anda hepsinden kaçarak denizin derinliklerine doğru koşmaya başladı.
2007 - Karanlıklar Denizi
Yaşam Maskesinin peşine düşen Toa Inika, dekompresyon hastalığından ölmesi pahasına Hahli'yi boğulmaktan kurtaran bilinmeyen bir Matoran'dan "batık şehri kurtar" şeklindeki gizemli ipucunu aldıktan sonra sulara indi.[14] Yaşam Maskesinden gelen bir enerji patlaması Toa Inika'yı su soluyan formlara dönüştürdü. Bin yıl önce Voya Nui'den koparak batmış olan Mahri Nui köyünü keşfettiler. Köy, Barraki olarak bilinen ve yakındaki "Çukur" adı verilen mutajenik sular tarafından mutasyona uğratılmış eski savaş lordları tarafından tehdit ediliyordu. Artık Toa Mahri olarak bilinen Toa, hayatta kalmak için Barraki'lerle karşı karşıya geldi. Ancak Toa maskeyi geri aldığında Büyük Ruh ölmüştü. Hâlâ umut olduğunu fark eden Toa Matoro, evrenin çekirdeğine koştu ve Mata Nui'yi canlandırmak için hayatını feda etti. Toa Matoro hayatının son anlarında Maskenin gücünü kullanarak Toa Mahri'yi Metru Nui'ye geri ışınladı ve tekrar hava solumalarını sağladı. Büyük Ruh'un hayatı kurtulmuştu ama yine de uyandırılması gerekiyordu.
2008 - Son Savaş
Artakha tarafından yeni zırhlar ve silahlar verildikten sonra Toa Nuva evrenin çekirdeği olan Karda Nui'ye vardı. Orada, Av-Matoran - Işık Matoranı - nüfusunu Gölge Matoran'a dönüştürmeye çalışan Makuta ile yüzleşmeye geldiler. Toa Nuva'ya, gölge sülüğü saldırısı sayesinde Işık ve Gölge'yi kontrol edebilen Takanuva'nın ve Yaşam Maskesi'nin kendisi olan Toa Ignika'nın gelişi yardımcı oldu. Kanohi Ignika kendisine bir beden yapmıştı çünkü yaşayan bir varlık olmanın nasıl bir şey olduğunu görmek istiyordu. Birleştirdikleri güçleriyle Karda Nui'nin merkezinde Codrex adı verilen bir yapıya ulaştılar ve burada Toa Ignika, Mata Nui'yi uyandırmak için yeni bedenini feda etmek zorunda kaldı. Takanuva, kalan bozulmamış Av-Matoran'ın yardımıyla Gölge Matoran'ı önceki hallerine döndürdü. Kısa bir süre sonra Toa, Mata Nui'nin uyanışının neden olduğu enerji fırtınası onları yok etmeden önce çekirdekten kaçtı. Ancak Makuta kaçmayı başaramadı ve hepsi öldürüldü. Metru Nui'ye dönüldüğünde, Mata Nui'nin uyanışı kutlandı, ancak Teridax'ın Mata Nui'nin bedenini ele geçirdiği ve Matoran evreni olduğu ortaya çıkınca kutlama kısa kesildi. Mata Nui'nin ruhunu Yaşam Maskesine hapsederek, eski Büyük Ruh'un evren üzerindeki kontrolüne müdahale edememesi için onu uzaya uçurdu.
2009 - Efsane Yeniden Doğuyor
Bionicle hikayesi, Mata Nui'nin Makuta Teridax tarafından Bara Magna adlı bir gezegene sürülmesinden sonra devam ediyor. Birkaç vahşi yaşam türü dışında, Bara Magna sadece birkaç kaynağı destekleyen çorak bir çöl gezegenidir, bu nedenle gezegendeki her kabilenin kendileri için savaşacak Glatorian adı verilen birkaç savaşçısı vardır. Yiyecek ve su gibi bu kaynaklar buna göre dağıtılır. Bu dünyanın köylüleri Agori olarak bilinir. Agoriler birlikte, her biri bir bölgeye bağlı altı farklı kabileyi oluşturur. Yaşam Maskesi Bara Magna'ya indikten sonra, Mata Nui'nin kullanması için bir beden yaratır. Mata Nui daha sonra köyler için iki büyük tehdit olan Skrall ve Kemik Avcıları'nın birleşik güçlerini yenmek için birkaç Glatorian ile birlikte çalışır ve bedenine dönmenin bir yolunu arar. Yeni Glatorian ve Agori arkadaşlarının yardımıyla Metus olarak bilinen bir haini ortaya çıkarır ve Skrall ile Kemik Avcılarını yener. Dünyanın köylerinin birleşmesine yardımcı olur, tüm dev robot parçalarını alır ve onları Matoran Evreninin içinde bulunduğu gibi büyük bir prototip robotik bedene bağlar.
2010 - Yolculuğun Sonu
Skrall'ı yendikten ve diğer köylerin birleştiğini gördükten sonra Mata Nui, eski bedenini Teridax'tan geri alma mücadelesine karşı durur. Çekirdek Savaşı'nın sonucu olarak şu anda bir orman ayı (Bota Magna), bir okyanus ayı (Aqua Magna) ve kalan çöl gezegeni (Bara Magna) olarak bölünmüş olan Spherus Magna gezegeninde Yüce Varlıklar tarafından yaratıldığını öğrenir. Mata Nui ayrıca kendisi inşa edilmeden önce, Agorilerin evleri olarak kullandıkları bir önceki robotun var olduğunu öğrenir. Tesara'dan Tarduk adında bir Agori, Mata Nui'ye eski robota güç verebilecek eski bir güç kaynağı göstererek yardımcı olur.
Bu son yolculukta, iki kahraman savaşı bitirmek için geri döner: Güçlü Altın Zırhı giymek için orijinal formuna geri dönen Tahu ve Takanuva. Onlara Gresh yardım eder. Makuta'yı yenmek için Skakdi Savaş Lordu Nektann ve ordusuyla; ısı görüşüne sahip Rahkshi ordularıyla ve Skrall'la savaşırlar.
Hikaye, hem Matoran Evreni'nin hem de Glatorian'ın güçlerinin Skakdi, Rahkshi ve Skrall'ın yaklaşan saldırısıyla yüzleşmesiyle devam ediyor. Makuta'nın patlamasıyla dağılan altın zırh Tahu, Gresh ve Takanuva tarafından birçok düşmandan toplanır. Tahu Skakdi savaş lordu Nektann'ı yener ve ardından zırhı giyerek Bara Magna'daki tüm Rahkshi Kraata'ları yakar.
Teridax, Bara Magna'yı yerçekimi enerjisiyle yok edeceğini iddia eder, ta ki Mata Nui kolunu yukarı doğru iterek Teridax'ın enerji dalgasını yukarıdaki aylara göndermesine neden olana kadar. Mata Nui, Teridax'ı akın eden aylardan birine, Bota Magna'nın yeşil ayına geri iter ve bu ayın çarpması Teridax'ın çekirdek işlemcisini yok ederek Teridax'ı öldürür. Mata Nui daha sonra zihninde sahip olabileceği kardeşinin yasını tutar.
Final, Mata Nui'nin gücünü ve Yaşam Maskesi'nin gücünü Spherus Magna'yı bir kez daha bir araya getirmek, Pit Mutagen tarafından mutasyona uğrayanları iyileştirmek, gezegene yaşamı geri getirmek ve yok edilen coğrafi özellikleri yeniden inşa etmek için kullanmasıyla sona erer. Zorlanma, güç çekirdeğinin dağılmasına ve prototip robotun yok olmasına neden olur. Glatorian ve Toa, Ignika'yı Mata Nui'nin bulunduğu yerde zarar görmemiş halde bulduklarında, Mata Nui Yaşam Maskesinin içinden onlarla konuşur. Onlara geleceğin kendilerine ait olduğunu ve inşa etmeleri gerektiğini söyler. Daha sonra Ignika'da uykuda kalır. Agori, Matoran, Toa, Glatorian ve diğerleri Spherus Magna'da yeni bir hayata başlar.
Bionicle'ın Geleceği
Bionicle oyuncak serisi, 2010 setlerinin piyasaya sürülmesi tamamlandıktan sonra 2009'un sonlarında sona erdi ve 2010 yazında Bionicle setleriyle uyumlu bir Lego teması olan Hero Factory ile değiştirildi. Ancak buna rağmen, hikaye Greg Farshtey tarafından BIONICLEstory.com adresinde çevrimiçi olarak yazılan serilerde devam ediyor.
