1 Ocak 1997'de Infobases'in ana şirketi Western Standard Publishing, Ancestry, Inc. şirketini satın aldı. Web sitesi, Ancestry dergisi ve soybilim kitaplarının yayıncısıydı. Web sitesi 1983 yılında John Sittner tarafından kurulmuştur. Başlangıçta web sitesi soybilim hakkında bir bültendi. Ancestry dergisi Ocak 1994'te yayın hayatına başlamıştı. Western Standard Publishing'in CEO'su Joe Cannon idi. Geneva Steel'in ana sahibiydi. Temmuz 1997'de Allen ve Taggart, Western Standard'ın Ancestry, Inc. şirketindeki hisselerini satın aldı. Aynı ay Ancestry, Inc. şirketi, LDS Kilisesi liderleri ve görevlileri tarafından yazılan kitapların yayıncısı Bookcraft, Inc. şirketini satın aldı. Bu tarihten itibaren Allen ve Taggart Ancestry, Inc. şirketini bağımsız olarak işletmeye başladı.
MyFamily.com web sitesi Aralık 1998'de açıldı. Mart 1999'da daha fazla ücretsiz site açıldı. MyFamily.com, ilk 140 gün içinde bir milyon kayıtlı kullanıcıya sahip oldu. Şirket yatırımcılardan 90 milyon dolardan fazla risk sermayesi topladı. 17 Kasım 1999'da şirketin adı Ancestry.com, Inc. iken MyFamily.com, Inc. olarak değiştirildi. Üç İnternet soybilim sitesi daha sonra Ancestry.com, MyFamily.com ve FamilyHistory.com olarak adlandırıldı. 2002 yılı satışları yaklaşık 62 milyon dolar, 2003 yılı satışları ise 99 milyon dolardı. Şirket Mart 2004'te Utah, Provo'da bir çağrı merkezi açtı. 19 Aralık 2006'da şirket adını "The Generations Network" olarak değiştirdi. Şirket, LDS Aile Tarihi Merkezlerinde Ancestry.com'a ücretsiz erişim sağladı. Bu hizmet 17 Mart 2007 tarihinde kaldırıldı. Bunun nedeni karşılıklı bir anlaşmanın olmamasıydı. 2010 yılında Ancestry, Aile Tarihi Merkezlerinde sitesine erişimi yeniden sağladı.
6 Temmuz 2009'da şirket adını tekrar Ancestry.com olarak değiştirdi. Bir yıl sonra Ancestry kitap yayıncılığı varlıklarını Turner Publishing'e sattı. Aynı yıl, Ancestry dergisi 25 yılın ardından artık yayınlanmıyordu. 5 Kasım 2009 tarihinde Ancestry.com NASDAQ'da halka açık bir şirket haline geldi (sembol: ACOM). İlk halka arzı, hisse başına 13,50 $ fiyatla 7,4 milyon hisse olarak gerçekleşti. Şirketin NBC ile Who Do You Think You Are adlı bir televizyon dizisi için ortaklığı vardı.
Ancestry.com 2010 yılında San Francisco, Kaliforniya'ya taşınmıştır. San Francisco ofisi şirketin teknoloji yönüne odaklanmaktadır. Son çalışmaları arasında bir iPhone ve iPad uygulaması bulunmaktadır. Aralık 2011'de Ancestry.com, 10 yıl içinde ölen kişiler için Sosyal Güvenlik Ölüm Endeksini kaldırdı. Bu kayıtlar kimlik hırsızlığı endişeleri nedeniyle kaldırılmıştır. Eylül 2012'de Ancestry.com, İrlanda'nın Dublin kentinde Avrupa merkezinin açılmasıyla uluslararası operasyonlarını genişletti. Dublin ofisi, uluslararası müşteriler için yeni bir çağrı merkezinin yanı sıra ürün, pazarlama ve mühendislik ekiplerini de içeriyor.
Ekim 2012'de Ancestry.com, Permira Advisers LLP, CEO Tim Sullivan ve CFO Howard Hochhauser dahil olmak üzere Ancestry.com'un yönetim ekibi üyeleri ve Spectrum Equity'den oluşan bir özel sermaye grubu tarafından hisse başına 32 $ veya yaklaşık 1,6 milyar $ karşılığında satın alınmayı kabul etti. Ancestry.com aynı zamanda 1000Memories adlı bir fotoğraf dijitalleştirme ve paylaşım hizmetini de satın aldı. Eylül 2013'te Ancestry.com Find a Grave'i satın aldığını duyurdu. Bir ay sonra şirket, Şubat 2013'te faaliyetlerini durduran Güney Afrika soybilim sitesi Ancestry24'ün aile tarihi kayıtlarını satın aldığını duyurdu.