Khoisan, Güney Afrika'da yaşayan iki halkın adıdır: San ve Khoikhoi. Sanlar yiyecek arayan ormancılardır ve Khoi'ler daha önce Hottentotlar olarak bilinen pastoral bir halktır. İki grup arasındaki ilişki çok net değildir. Sanlar genellikle bölgedeki diğer insanlardan daha küçüktür. Ayrıca oradaki diğer insan gruplarından çok farklı görünüyorlar. 2018 yılı itibariyle 90.000 ila 100.000 arasında San kalmıştır. Bunların çoğu Botsvana ve Namibya'da yaşamaktadır. Güney Afrika, Angola, Zambiya ve Zimbabve'de de San azınlıklar bulunmaktadır.
Sanlar, Güney Afrika'nın orijinal (yerli) sakinlerinden bazılarıydı. Daha sonra Kuzey ve Doğu Afrika'dan güneye doğru Bantu göçleri 700 yıl önce bölgeye ulaştı.[when?] Bantu nüfusu Khoi ve Sanları yerinden ederek Güney Afrika'nın baskın sakinleri haline geldi.
Bir evrimsel genetikçiye göre Khoisan "bir noktada Dünya'daki en büyük nüfustu". Khoisan'ın Güney Afrika'daki orijinal varlığının kanıtı, dillerinin bugünkü dağılımıdır. Khoisan dil grupları yakın olmalarına rağmen yapı ve kelime dağarcığı bakımından genellikle aşırı farklılıklar gösterir ki bu da aynı bölgede uzun bir yerleşim ve dillerin birlikte evrimleşmesi döneminin yaşandığını gösterir.
Charles Darwin 1882'de The Descent of Man (İnsanın Türeyişi) adlı eserinde Khoisanlar ve cinsel seçilim hakkında yazmış, steatopygia'larının insan evriminde cinsel seçilim yoluyla evrimleştiği ve "vücudun arka kısmının çok harika bir şekilde çıkıntı yaptığı" yorumunda bulunmuştur.
1990'larda dünya halkları üzerinde yapılan genomik çalışmalar, San erkeklerinin Y kromozomunun diğer tüm popülasyonlardan farklı polimorfizm kalıplarını paylaştığını ortaya koymuştur. Y kromozomu çok az değiştiği için, bu tür bir DNA testi farklı insan alt gruplarının birbirinden ne zaman ayrıldığını belirlemek için kullanılmaktadır. Bu da onların son ortak atalarını gösterir. Bu çalışmaların yazarları, Sanların, 60.000 ila 90.000 yıl önce yaşadığı tahmin edilen, yaşayan tüm insanların en son ortak atasından farklılaşan ilk popülasyonlardan biri olabileceğini öne sürmektedir.



