Genom
Bir organizmanın genomu, DNA'sında (veya bazı virüsler için RNA'sında) kodlanmış kalıtsal bilgilerinin tamamıdır. Bu, hem genleri hem de DNA'nın kodlama yapmayan dizilerini içerir. Profesör Hans Winkler bu terimi 1920 yılında ortaya atmıştır.
Winkler'in tanımının çevirisi şöyledir:
"İlgili protoplazma ile birlikte türlerin maddi temellerini belirleyen haploid kromozom seti için genom ifadesini öneriyorum ...." p165
Ancak, hiçbir haploid kromozom seti bir türün DNA'sını bile tanımlamaz. Bir popülasyon tarafından taşınan çok çeşitli aleller nedeniyle, her birey genetik olarak farklıdır. Diploid bir birey bile genetik çeşitlilik taşır. Bu nedenle Dobzhansky "kromozom kümesi "ni tercih etmiştir ve tanım artık Winklers'ın tanımından daha geniş olmalıdır. Haploid bir kromozom setinin genomu, bir türün toplam genetik çeşitliliğinin yalnızca bir örneğidir.
'Genom' terimi özellikle tüm nükleer DNA setini ('nükleer genom') ifade etmek için kullanılabileceği gibi mitokondriyal genom veya kloroplast genomunda olduğu gibi kendi DNA'larını içeren organeller için de kullanılabilir.
Genom boyutları
| Organizma | Genom büyüklüğü (baz çifti) | Not |
| Virüs, Bakteriyofaj MS2 | 3569 | İlk dizilenmiş RNA-genomu |
| Virüs, SV40 | 5224 | |
| Virüs, Faj Φ-X174 | 5386 | İlk dizilenmiş DNA-genomu |
| Virüs, Faj λ | 5×10 4 | |
| 1.6×10 5 | Viral olmayan en küçük genom, Şubat 2007 | |
| Bakteri, Escherichia coli | 4×10 6 | En iyi araştırılmış bakteri. |
| Bakteri, Solibactoer usitatus | 1×10 7 | Bilinen en büyük bakteri genomu |
| Protist, Amoeba dubia | 6.7×10 11 | Bilinen en büyük genom, ancak tartışmalı. |
| Bitki, Arabidopsis thaliana | 1.57×10 8 | İlk bitki genomu dizilendi, Aralık 2000. |
| Bitki, Genlisea margaretae | 6.34×10 7 | Kaydedilen en küçük çiçekli bitki genomu, 2006. |
| Bitki, Fritillaria assyrica | 1.3×10 11 | |
| Bitki, Populus trichocarpa | 4.8×10 8 | İlk ağaç genomu, Eylül 2006 |
| Maya, Saccharomyces cerevisiae | 2×10 7 | |
| Mantar, Aspergillus nidulans | 3×10 7 | |
| Nematod, Caenorhabditis elegans | 9.8×10 7 | İlk çok hücreli hayvan genomu, Aralık 1998. |
| Böcek, Drosophila melanogaster diğer adıyla meyve sineği | 1.3×10 8 | |
| Böcek, Bombyx mori diğer adıyla ipek güvesi | 5.30×10 8 | |
| Böcek, Apis mellifera diğer adıyla bal arısı | 1.77×10 9 | |
| Balık, Tetraodon nigroviridis, Kirpi balığı türü | 3.85×10 8 | Bilinen en küçük omurgalı genomu |
| Memeli, Homo sapiens | 3×10 9 | |
| Balık, Protopterus aethiopicus aka mermer akciğerli balık | 1.3×10 11 | Bilinen en büyük omurgalı genomu |
Not: Tek bir insan hücresinden elde edilen DNA ~1,8 m uzunluğa sahiptir (ancak ~2,4 nanometre genişliğindedir).
İlgili sayfalar
- Gene
- Dizi analizi
- İnsan genomu
- ENCODE: insan genomunun eksiksiz analizi
Sorular ve Yanıtlar
S: Genom nedir?
C: Genom, bir organizmanın DNA'sında (veya bazı virüsler için RNA'sında) kodlanmış kalıtsal bilginin tamamıdır. Bu, hem genleri hem de DNA'nın kodlama yapmayan dizilerini içerir.
S: "Genom" terimini kim icat etti?
C: Profesör Hans Winkler 1920 yılında "genom" terimini ortaya atmıştır.
S: Winkler genom olarak neyi tanımladı?
C: Winkler genomu "ilgili protoplazma ile birlikte türün maddi temellerini belirleyen haploid kromozom seti" olarak tanımlamıştır.
S: Her birey genetik çeşitliliğe sahip midir?
C: Evet, bir popülasyon tarafından taşınan aleller nedeniyle her birey genetik olarak farklıdır. Diploid bireyler bile genetik çeşitlilik taşır.
S: 'Nükleer genom' dediğimizde ne anlama gelir?
C: 'Nükleer genom' dediğimizde, bu özellikle nükleer DNA'nın tamamı anlamına gelir.
S: Nükleer genom dışında başka genomlar da var mıdır?
C: Evet, kendi DNA'larını içeren mitokondriyal genomlar ve kloroplast genomları da vardır.
