Carsonella ruddii

Yazar: Leandro Alegsa

18-06-2022

Candidatus Carsonella ruddii endosimbiyotik bir gamma proteobakteridir. Herhangi bir bakterinin bilinen en küçük genomuna sahiptir.

Bu tür, psyllid olarak bilinen floem özsuyu ile beslenen böceklerin tüm türlerinde bulunan bir endosimbionttur. Endosimbiontlar, bakteriyom olarak bilinen özel bir yapıda meydana gelir.

2006 yılında bir Ca türünün genomu C. ruddi'nin genomu Japonya'daki RIKEN ve Arizona Üniversitesi'nde dizilenmiştir. Genom 159.662 baz çiftinden oluşan dairesel bir kromozomdur ve birçok örtüşen gen ve azaltılmış gen uzunluğu ile yüksek bir kodlama yoğunluğuna (%97) sahiptir. Tahmin edilen gen sayısı 182'dir ve bu da kayıtlardaki en düşük sayıdır (NCBI-Genome). Yaşam için gerekli olduğu düşünülen çok sayıda gen eksik görünmektedir, bu da türün organel benzeri bir statüye ulaşmış olabileceğini düşündürmektedir.

Buna karşılık, serbest yaşayan organizmalar arasında en küçük genoma sahip olan Mycoplasma genitalium, 521 genden oluşan bir genoma sahiptir.

Sorular ve Yanıtlar

S: Candidatus Carsonella ruddii nedir?

C: Candidatus Carsonella ruddii, psyllid olarak bilinen floem özsuyu ile beslenen böceklerin tüm türlerinde bulunan endosimbiyotik bir gama proteobakteridir.

S: Candidatus Carsonella ruddii'nin genomunun boyutu nedir?

C: Candidatus Carsonella ruddii'nin genomu, herhangi bir bakterinin bilinen en küçük genomudur ve 159.662 baz çiftinden oluşan dairesel bir kromozomdur.

S: Candidatus Carsonella ruddii'de kaç gen bulunduğu tahmin edilmektedir?

C: Candidatus Carsonella ruddii'de tahmin edilen gen sayısı 182'dir ve bu sayı kayıtlardaki en düşük sayıdır (NCBI-Genome).

S: Candidatus Carsonella ruddii genomunun kodlama yoğunluğu nedir?

C: Candidatus Carsonella ruddii'nin genomu %97 gibi yüksek bir kodlama yoğunluğuna sahiptir.

S: Bakteriyom nedir?

C: Bakteriyom, Candidatus Carsonella ruddii'de endosimbiontların meydana geldiği özelleşmiş bir yapıdır.

S: Candidatus Carsonella ruddii'nin genomunda eksik olan nedir?

C: Candidatus Carsonella ruddii'nin genomunda yaşam için gerekli olduğu düşünülen çok sayıda gen eksik görünmektedir, bu da türün organel benzeri bir statüye ulaşmış olabileceğini düşündürmektedir.

S: Candidatus Carsonella ruddii'nin genomu Mycoplasma genitalium'un genomu ile nasıl karşılaştırılır?

C: Serbest yaşayan organizmalar arasında en küçük genoma sahip olan Mycoplasma genitalium'un genomu, Candidatus Carsonella ruddii'de tahmin edilen gen sayısından önemli ölçüde daha fazla olan 521 gene sahiptir.