Gemi, 20. yüzyıl kaşifi Ernest Shackleton'ın Drake Geçidi (genellikle fırtınalı ve dalgalı denizlere sahip bir bölge) boyunca izlediği rotayı takip etmeyi amaçlayan 19 günlük bir seyir için 11 Kasım 2007 tarihinde Arjantin'in Ushuaia kentinden ayrıldı. Explorer, Falkland Adaları ve Güney Georgia Adası'nı ziyaret ettikten sonra 23 Kasım 2007'de Antarktika Okyanusu'nda, Güney Shetland Adaları yakınlarındaki King George Adası'na yakın Bransfield Boğazı'nda tanımlanamayan bir batık cisme çarptı. Explorer'ın çarptığı cisim geminin iskele tarafında (sol taraf) 10'a 4 inçlik (25 × 10 cm) bir delik açarak gemiye deniz suyu girmesine neden olmuştur.
Bir yolcu UTC 03:00 sularında kabinde deniz suyu olduğunu bildirmiştir. Bazı raporlar gözle görülür bir darbe olmadığını ya da en azından buzlu sularda seyrederken yaşanan normal buz çıtırtılarından daha fazla bir şey olmadığını belirtse de, diğer raporlar yüksek bir patlama olduğunu söylemektedir. Bazı raporlar da mürettebatın geminin iskele tarafındaki ilk çarpmanın neden olduğu hasarı değerlendirirken geminin Explorer'ın sancak tarafındaki bir buzdağına doğru sürüklendiğini belirtmektedir.
Gemi tarafından UTC 04:24'te bir yardım çağrısı yapıldı ve kurtarma operasyonları Arjantin Cumhuriyeti Prefectura Naval (Sahil Güvenlik Kolordusu) ve Şili Donanması Arama ve Kurtarma Merkezi tarafından hızla koordine edildi. Şili, buz kırıcı Almirante Viel'i ve MN Ushuaia, National Geographic Endeavor ve o sırada yolcu gemisi olarak faaliyet gösteren Norveç Kıyı Ekspresi gemisi MS Nordnorge dahil olmak üzere yakındaki ticari gemileri gönderdi. Saat 07:30 UTC itibariyle, 14'ten fazla ülkeden 91 yolcu, 9 rehber ve 54 mürettebatın tamamı gemiyi terk ederek can sallarına binmiş ve saat 10:00 UTC itibariyle olay yerine ulaşan Norveç gemisi MS Nordnorge tarafından alınana kadar üç ila dört saat boyunca sürüklenmişlerdir. Explorer'ın UTC saatiyle 19:00 sularında battığı düşünülmektedir. Tesadüfen, 2007 yılının başlarında MS Nordnorge, aynı uzak Güney Shetland Adaları takımadalarının bir parçası olan Deception Adası'nda Nordkapp'ın karaya oturması üzerine kardeş gemi MS Nordkapp'tan 294 yolcuyu tahliye ettiğinde başka bir Antarktika kurtarma operasyonunda yer almıştı.
Nordnorge tarafından kurtarılanlardan bazıları King George Adası'ndaki Şili Eduardo Frei Montalva İstasyonu'na götürüldü. Daha sonra Şili Hava Kuvvetleri'ne ait C-130 Hercules nakliye uçağı ile 24 Kasım 2007 Cumartesi ve 25 Kasım 2007 Pazar günü iki ayrı uçuşla Şili'nin Punta Arenas kentine götürülmüşlerdir. Kazazedelerden yaklaşık 70'i Uruguay'ın Artigas Üssü'ne götürüldü. Explorer, buz olduğu bildirilen bilinmeyen bir cisme çarptıktan sonra 20 saat içinde battı.