X-ışını kristalografisi bir molekülün üç boyutlu yapısını görmenin bir yoludur. Bir atomun elektron bulutu X-ışınlarını hafifçe büker. Bu da molekülün ekranda görülebilen bir "resmini" oluşturur. Hem organik hem de inorganik moleküller için kullanılabilir. İşlem sırasında numune tahrip olmaz.

Bu teknik Sir William Bragg (1862-1942) ve oğlu Sir Lawrence Bragg (1890-1971) tarafından ortaklaşa icat edilmiştir. İkili 1915 yılında Nobel Fizik Ödülü'nü kazanmıştır. Lawrence Bragg Nobel Ödülü'ne layık görülen en genç kişidir. Şubat 1953'te James D. Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins ve Rosalind Franklin tarafından DNA'nın yapısı keşfedildiğinde Cambridge Üniversitesi Cavendish Laboratuvarı'nın direktörüydü.

X-ışını kristalografisinin en eski yöntemi X-ışını kırınımıdır (XRD). X-ışınları tek bir kristale gönderilir ve dağılma şekilleri bir desen oluşturur. Bu desenler, kristalin içindeki atomların düzenini çözmek için kullanılır.