Bir molekül, kimyasal bir maddenin var olabilen en küçük miktarıdır. Eğer bir molekül daha küçük parçalara bölünseydi, farklı bir madde olurdu.
Moleküller, belirli bir şekil veya formda birbirine yapışmış atomlardan oluşur. Atomların tüm kombinasyonları eşit derecede mümkün değildir; atomlar belirli şekilleri diğerlerine tercih eder. Ayrıca, farklı değerliklere sahiptirler. Örneğin, oksijen atomlarının diğer atomlarla her zaman iki bağı vardır, karbon atomlarının diğer atomlarla her zaman dört bağı vardır ve nitrojen atomlarının diğer atomlarla her zaman üç bağı vardır.
Gazların kinetik teorisinde, molekül terimi genellikle bileşimine bakılmaksızın herhangi bir gaz parçacığı için kullanılır. Bu tanıma göre, soygaz atomları aslında tek atomlu moleküller oldukları için molekül olarak kabul edilirler.
Hava gibi gazlarda moleküller sadece etrafta uçuşur. Su gibi sıvılarda ise moleküller birbirine yapışmıştır ancak yine de hareket edebilirler. Şeker gibi katılarda ise moleküller sadece titreşebilir. Plazma olarak bilinen maddenin dördüncü halinde atomlar iyonize olur ve molekül oluşturamazlar.
Bir moleküler formülle, bir moleküldeki tüm atomların sayılarını yazabilirsiniz. Örneğin, glikozun moleküler formülü C6 H12 O6 şeklindedir. Bu, bir glikoz molekülünün altı karbon atomu, on iki hidrojen atomu ve altı oksijen atomundan oluştuğu anlamına gelir.
