Biyoyakıt, yakın zamanda cansız veya canlı biyolojik materyalden elde edilen yakıttır. Uzun süre önce ölmüş biyolojik materyalden elde edilen fosil yakıtlardan farklıdır. Biyoyakıt katı, sıvı veya gaz formlarında olabilir.
Biyoyakıtlar genellikle arabalara güç sağlamak, evleri ısıtmak ve yemek pişirmek için kullanılır. Biyoyakıt şirketleri çoğunlukla Avrupa, Asya ve Amerika'dan gelmektedir. Los Alamos Ulusal Laboratuarında geliştirilen teknolojiler, kirliliğin yenilenebilir biyoyakıta dönüştürülmesine bile olanak sağlamaktadır. Agro-yakıtlar, çöp sahası veya geri dönüştürülmüş malzeme gibi atık süreçlerinden ziyade belirli bitkilerden üretilen biyoyakıtlardır.
Bitkileri gaz ve sıvı yakıtlara dönüştürmenin iki yaygın yolu vardır. Birincisi, şeker (örn. Şeker kamışı) veya nişasta (örn. mısır) oranı yüksek ürünler yetiştirmek ve ardından etil alkolü (etanol) fermente etmek için maya kullanmaktır. İkincisi ise palmiye yağı, soya fasulyesi ve yosun gibi yüksek miktarda bitkisel yağ içeren bitkiler yetiştirmektir. Bu yağlar ısıtıldığında viskoziteleri azalır ve doğrudan bir dizel motorda yakılabilir ya da kimyasal olarak işlenerek biyodizel gibi yakıtlar üretilebilir. Odun ve yan ürünleri binlerce yıldır odun kömürü, odun gazı, metanol veya etanol yakıtı gibi biyoyakıtlara dönüştürülmektedir. Yenilebilir olmayan bitki parçalarından selülozik etanol yapmak da mümkündür, ancak bu pahalı olabilir.
Katı biyokütle de kullanılmaktadır. Yakacak odun binlerce yıldır kullanılmaktadır. Odun ve ot gibi birçok malzeme kurutulabilir, pelet haline getirilebilir ve yakılabilir ve bu da enerji üretmek için kullanılabilir.