Gen susturma, gen düzenlemesinin epigenetik süreçlerini tanımlayan genel bir terimdir. Genetik mühendisliği dışında bir mekanizma ile bir genin "kapatılmasını" tanımlamak için kullanılır. Yani, normal şartlar altında ifade edilecek ("açık") bir gen, hücre içindeki mekanizmalar tarafından kapatılır. Bir gen susturulduğunda, RNA'sının bir protein yapamadığı anlamına gelir.
Genler ya transkripsiyon aşamasında ya da daha sonra, translasyondan önce düzenlenir.
Transkripsiyonel gen susturma, bir genin etrafına heterokromatin yerleştiren histon modifikasyonları ile yapılır. Bu, transkripsiyonel makinenin (RNA polimeraz, transkripsiyon faktörleri, vb.) gene ulaşamayacağı anlamına gelir. Genler DNA metilasyonu ile susturulabilir. Bu, genler farklı aşamalarda açılıp kapandığında, gelişim sırasında düzenli olarak gerçekleşir.
Transkripsiyon sonrası gen susturma, belirli bir genin mRNA'sını bloke ederek veya yok ederek yapılır. mRNA'nın yok edilmesi, aktif bir gen ürünü (çoğu durumda bir protein) oluşturmak için çeviriyi önler. mRNA'nın susturulmasının yaygın bir yolu RNAi'dir.
Genleri düzenlemek için hem transkripsiyonel hem de post-transkripsiyonel gen susturma kullanılır. Gen susturma yöntemleri ayrıca organizmanın genomunu transpozonlardan ve virüslerden korur. Dolayısıyla gen susturma, hücreleri bu tür bulaşıcı DNA ve RNA'dan koruyan eski bir bağışıklık sisteminin parçası olabilir.