Werner Heisenberg'in yeni kuantum fiziğini yaratmasından çok kısa bir süre sonra, matematiğinden beklenmedik bir şey çıktı:
Δ x Δ p ≳ h 4 π {\displaystyle \Delta x\,\Delta p\gtrsim {\frac {h}{4\pi }}\qquad \qquad \qquad } 
Konumdaki (x) hata aralığı ile momentumdaki (p) hata aralığı çarpımı, Planck sabitinin 4π'ye bölümüne eşit ya da daha büyüktür.
Bu semboller, yukarıdaki resimlerde daha önce gördüğünüz şeyleri matematik formuna sokmaktadır. Bu semboller, bir şeyin nerede olduğu ve nereye gittiği konusunda tam olarak emin olamayacağınızı açık bir şekilde ifade etmektedir. Herhangi bir zamanda nerede olduğu konusunda netleşirseniz, nereye gittiği ve ne kadar hızlı gittiği konusunda daha az fikriniz olur. Herhangi bir zamanda nereye gittiği ve ne kadar hızlı gittiği konusunda netleşirseniz, o zaman şu anda nerede olduğu konusunda daha az fikriniz olur.
Bilim insanları, bazı maddelerin ısıtıldıklarında veya başka bir şekilde uyarıldıklarında neden karakteristik ışık renkleri yaydıklarını zaten öğrenmişlerdi. Heisenberg bu renklerin her birinin neden karakteristik bir parlaklığa sahip olduğunu açıklamaya çalışıyordu. Eğer o ve diğer bilim insanları sadece "Bu iş böyledir" deselerdi bu yeterince iyi olmazdı. Bu farklılıkların ve parlak çizgi güçleri arasındaki oranların bir elementin her örneği için her zaman aynı olmasının iyi bir nedeni olması gerektiğinden emindiler.
Elementlerin her birine özgü renkli çizgilerin yoğunluklarının açıklamasını keşfetmek için yola çıktığında doğanın gizli bir sırrına rastlayacağından habersizdi. Kuantum mekaniği çalışmaları, hidrojenin neden spektrumun insanların görebildiği kısmında dört parlak çizgiye sahip olduğunu zaten göstermişti. Öğrenilmesi gereken bir sonraki şeyin basitçe parlaklıklarının nasıl hesaplanacağı olduğu düşünülmüş olmalı. Hidrojenin uğraşması gereken sadece bir elektronu ve spektrumun görünür kısmında sadece dört çizgisi olduğu için hidrojen başlamak için bariz bir yer gibi görünüyordu. Elbette eşit derecede parlak olmamalarının iyi bir nedeni olmalı. Neon ve diğer elementlerin farklı renkteki çizgilerinin parlaklığının açıklaması bekleyebilirdi.
Heisenberg kuantum fiziği üzerinde çalışmaya, başlangıçta çok karmaşık olan elektrik için klasik denklemleri uyarlayarak başladı, bu nedenle 1925 makalesinin arkasındaki matematiği takip etmek çok zordu.
Hidrojen lambası spektrumundaki parlak çizgilerin yoğunluğunu hesaplamak için doğru yolu bulmaya çalışıyordu. İstediği yoğunluğu elde etmek için "genlik" adı verilen ilgili bir niceliği bulması ve genliği genlikle çarpması (ya da başka bir deyişle genliğin karesini alması) gerekiyordu. Genliği, hidrojen lambalarının tüm frekanslarda ışıma yapmadığı ve spektrumun insanların görebildiği kısmında sürekli bir frekans aralığında ışıma yapmadığı gerçeğini hesaba katacak şekilde nasıl ifade edeceğini bulması gerekiyordu. Heisenberg, genliği hesaplamak için dikkate değer yeni bir yol buldu.
Heisenberg'in keşfettiği ve bir kuantum niceliğini (örneğin konum) diğeriyle (örneğin momentum) çarpmak için kullandığı garip denklem, "Heisenberg'in Temmuz 1925 tarihli 'sihirli' makalesi" olarak adlandırılan makalede yayınlandı.
C ( n , n - b ) = ∑ a A ( n , n - a ) B ( n - a , n - b ) {\displaystyle C(n,n-b)=\sum _{a}^{}\,A(n,n-a)B(n-a,n-b)} 
Yukarıdaki matematik çok zor görünüyor, ancak buna yol açan matematik çok daha zor ve anlaşılması son derece zor. Burada sadece neye benzediğini göstermek için verilmiştir. Heisenberg'in makalesi tarihi bir dönüm noktasıdır. Makalesini okuyan birçok fizikçi, Heisenberg'in vardığı sonuçlara katılmadıklarını, ancak bu sonuçlara nasıl ulaştığına dair açıklamalarını takip edemediklerini söylemiştir. Heisenberg'in kullandığı başlangıç denklemleri Fourier serilerini içeriyordu ve birçok faktör içeriyordu. Yukarıdaki denkleme geri döneceğiz çünkü matrisleri yazmak ve çarpmak için bir tür reçetedir.
Yeni denklemler çok garip ve alışılmadık olmak zorundaydı çünkü Heisenberg elektronların yörüngeleri gibi bazı şeylerin yavaş yavaş büyümediği ya da küçülmediği garip bir dünyayı tanımlıyordu. Yeni değişim türleri sıçramalar ve sıçramalar arasında büyük boşluklar içerir. Elektronlar yalnızca belirli yörüngeler arasında sıçrayabilir ve yörüngeler arasında geçiş yaparken kazanılan ya da kaybedilen enerji, doğru enerjide bir foton emildiğinde ya da doğru enerjide yeni bir foton üretildiğinde ortaya çıkar. Hidrojen atomlarındaki elektronlar en sık iki belirli yörünge arasında zıplarsa (düşerse), o enerji seviyesinde daha fazla foton yayılır ve böylece o seviyede üretilen ışık en yoğun olur.
Sürekli spektrumlar (güneş ışığını bir prizmadan geçirdiğinizde gördüğünüz şey) için oluşturulmuş denklemleri, aralarında hiçbir şey olmayan sadece birkaç tepe frekansı olan spektrumlara uydurmak zordu. Işık ve enerji hakkında öğrenilen neredeyse her şey yanan mumlar veya güneşler gibi büyük nesnelerle yapılmıştı ve bu büyük nesnelerin hepsi sürekli spektrumlar üretiyordu. Bu sıradan büyüklükteki şeylerle deney yapmak kolay olsa da, onları yöneten yasaları (fizik) bulmak yine de uzun zaman almıştı. Şimdi fizikçiler görülemeyecek kadar küçük, sürekli spektrum üretmeyen şeylerle uğraşıyor ve en azından bildiklerinden bu küçük ve boşluklu ışık kaynaklarının yasalarını bulmalarına yardımcı olacak ipuçları elde etmenin bir yolunu bulmaya çalışıyorlardı.
Orijinal denklemler, bir orgdaki kamışın karakteristik frekansta bir ses dalgası üretmesine benzer şekilde, bir dalga üretecek bir tür titreşen cisimle ilgiliydi. Yani ileri ve geri hareket vardı (bir kamışın titreşimi gibi) ve sinüs dalgası olarak grafiğe geçirilebilecek bir dalga yayılıyordu. Atomik düzeyde fizik hakkında daha önce anlaşılanların çoğu, çekirdeklerin etrafında hareket eden elektronlarla ilgiliydi. Bir kütle bir yörüngede hareket ettiğinde, bir tür merkez etrafında döndüğünde, "açısal momentum" denen şeye sahip olur. Açısal momentum, atlıkarınca gibi bir şeyin, insanlar onu itmeyi bıraktıktan sonra dönmeye devam etmesinin yoludur. Faz hesaplamaları ve açısal momentum için kullanılan matematik karmaşıktır. Üstelik Heisenberg 1925 tarihli makalesinde tüm hesaplamalarını göstermemiştir, bu nedenle iyi matematikçiler bile onun söylemediği şeyleri tamamlamakta zorlanabilir.
Birçok fizikçi Heisenberg'in çığır açan makalesindeki çeşitli matematik adımlarını çözemediklerini söylese de, Heisenberg'in sonuca nasıl ulaştığını açıklamaya çalışan yakın tarihli bir makale yirmi matematik dolu sayfa kullanıyor. Bu makaleyi anlamak bile kolay değil. Matematik gerçekten zor şeylerle başladı ve sonunda bu makalenin başında gösterilen nispeten basit bir şey üretti. Daha basit bir sonuca ulaşmak kolay değildi ve biz de evrenin modası geçmiş bir resminden yeni kuantum fiziğine geçiş sürecini göstermeye çalışmayacağız. Heisenberg buluşunu yapar yapmaz, evrenin işleyişinin daha önce kimsenin görmediği bir parçasının ortaya çıktığını göstermeye yetecek kadar ayrıntıya ihtiyacımız var.
Heisenberg gece geç saatlerde nihayet buluşunu gerçekleştirdiğinde ve bunun işe yarayacağını kendi kendine kanıtlamaya başladığında çok heyecanlı ama aynı zamanda çok yorgun olmalıydı. Neredeyse hemen garip bir şey fark etti, bir şekilde ortadan kaldırabileceği can sıkıcı küçük bir sorun olduğunu düşündüğü bir şey. Ancak bu küçük sıkıntının büyük bir keşif olduğu ortaya çıktı.
Heisenberg genlikleri genliklerle çarpmak için çalışıyordu ve şimdi Heisenberg yeni denklemini kullanarak genliği ifade etmenin iyi bir yoluna sahipti. Doğal olarak çarpma işlemi ve karmaşık denklemler cinsinden verilen şeyleri nasıl çarpacağı hakkında düşünüyordu.
Heisenberg, genliğin karesini almanın yanı sıra, sonunda konumu momentumla çarpmak ya da enerjiyi zamanla çarpmak isteyeceğini fark etti ve bu yeni durumlarda sıralamayı tersine çevirirse bir fark yaratacak gibi görünüyordu. Heisenberg, konumun momentumla mı yoksa momentumun konumla mı çarpıldığının önemli olmaması gerektiğini düşünüyordu. Eğer bunlar sadece basit sayılar olsalardı hiçbir sorun olmazdı. Ancak her ikisi de karmaşık denklemlerdi ve denklemlere girecek sayıları nasıl elde edeceğiniz, hangi yoldan başladığınıza bağlı olarak farklılık gösteriyordu. Doğada önce konumu sonra momentumu ölçmek zorundaydınız ya da önce momentumu sonra konumu ölçmek zorundaydınız ve matematikte de aynı genel durum geçerliydi. (Ayrıntıları öğrenmek istiyorsanız İngilizce Wikipedia'daki Heisenberg'in matris mekaniğine giriş makalesine bakın!) Sonuçlar arasındaki küçük ama sinir bozucu farklar, Heisenberg bunların ortadan kalkmasını ne kadar isterse istesin, kalmaya devam edecekti.
O sırada Heisenberg bu küçük problemden kurtulamamıştı ama çok yorulmuştu, bu yüzden çalışmasını ilk amiri Max Born'a teslim etti ve tatile çıktı.
Max Born, Heisenberg'in kendisine verdiği denklemin bir matris yazmak için bir tür reçete olduğunu kısa sürede gören olağanüstü bir matematikçiydi. Dr. Born, o dönemde çoğu insanın pek bir işe yaramadığını düşündüğü bu tuhaf matematik türüyle ilgilenen az sayıdaki insandan biriydi. Matrislerin çarpılabileceğini biliyordu, dolayısıyla bir fizik probleminin hesaplanmasına yönelik tüm hesaplamalar bir matrisin diğeriyle çarpılmasıyla halledilebilirdi. Karmaşık bir prosedürü standart ve kabul edilebilir bir forma sokabilmek, onunla çalışmayı kolaylaştıracaktı. Ayrıca diğer insanların kabul etmesini de kolaylaştırabilir.
Born o kadar iyi bir matematikçiydi ki, iki matrisin çarpım sırasını değiştirmenin farklı bir sonuç üreteceğini ve sonuçların küçük bir miktar farklı olacağını hemen fark etti. Bu miktar h/2πi olacaktır. Günlük yaşamda bu fark o kadar küçük olurdu ki, bunu göremezdik bile.