Anfinsen'in dogması
Anfinsen'in dogması, Christian Anfinsen tarafından moleküler biyolojide öne sürülen bir hipotezdir. Fikir, bir proteinin doğal yapısına katlanmasının, proteinin amino asit dizilimi tarafından otomatik olarak yapıldığıdır. Bu sadece bazı proteinler için doğrudur. Diğer proteinler için şaperonlara ihtiyaç vardır.
Anfinsen, ribonükleaz A enziminin yapısı üzerine yaptığı çalışmayla 1972 Nobel Kimya Ödülü'nü paylaşmıştır. Bu dogma, katlanmanın gerçekleştiği koşullarda doğal yapının benzersiz ve kararlı bir durum olduğunu öne sürmektedir. Üç koşul vardır:
benzersizlik
dizinin karşılaştırılabilir bir serbest enerjiye sahip başka bir konfigürasyona sahip olmamasını gerektirir.
kararlılık
Çevredeki küçük değişiklikler minimum konfigürasyonda değişikliklere yol açamaz.
kinetik erişilebilirlik
nihai şeklin, şekil üzerinde son derece karmaşık değişikliklere gidilmeden (örneğin düğümler gibi) elde edilebileceği anlamına gelir.
Proteinin bu yapıya nasıl ulaştığı, Levinthal paradoksu adı verilen ilgili bir dogmaya sahip olan protein katlanması alanının konusudur. Levinthal paradoksu, belirli bir protein için mevcut olası konformasyonların sayısının astronomik derecede büyük olduğunu, öyle ki 100 kalıntıdan oluşan küçük bir proteinin bile tüm olası konformasyonları keşfetmek (1026 saniye) ve uygun olanı seçmek için evrenin var olduğundan daha fazla zamana ihtiyaç duyacağını belirtir.
Prionlar Anfinsen'in dogmasının bir istisnasıdır. Prionlar, doğal katlanma durumundan farklı olan proteinlerin kararlı konformasyonlarıdır. Sığır spongiform ensefalopatisinde (Deli Dana Hastalığı), doğal proteinler farklı bir kararlı konformasyona yeniden katlanır ve bu da ölümcül amiloid birikimine neden olur. Alzheimer hastalığı ve Parkinson hastalığı da dahil olmak üzere diğer amiloid hastalıkları da Anfinsen'in dogmasının istisnalarıdır.
Ribonükleaz A'nın katlanmış, 3 boyutlu yapısı
Sorular ve Yanıtlar
S: Anfinsen'in dogması nedir?
C: Anfinsen dogması, moleküler biyolojide Christian Anfinsen tarafından ortaya atılan ve bir proteinin doğal yapısına katlanmasının proteinin amino asit dizilimi tarafından otomatik olarak yapıldığını öne süren bir hipotezdir.
S: Benzersizlik, kararlılık ve kinetik erişilebilirlik için üç koşul nedir?
C: Benzersizlik, dizinin karşılaştırılabilir bir serbest enerjiye sahip başka bir konfigürasyona sahip olmamasını gerektirir. Kararlılık, çevredeki küçük değişikliklerin minimum konfigürasyonda değişikliklere yol açamayacağı anlamına gelir. Kinetik erişilebilirlik, nihai şeklin, şekildeki son derece karmaşık değişikliklerden (örneğin düğümler gibi) geçmeden elde edilebileceği anlamına gelir.
S: Levinthal paradoksu nedir?
C: Levinthal paradoksu, belirli bir protein için mevcut olası konformasyonların sayısının astronomik olarak büyük olduğunu, öyle ki 100 kalıntıdan oluşan küçük bir proteinin bile tüm olası konformasyonları keşfetmek (1026 saniye) ve uygun olanı seçmek için evrenin var olduğundan daha fazla zaman gerektireceğini belirtir.
S: Anfinsen'in dogmasının istisnaları var mı?
C: Evet, prionlar ve Bovine spongiform encephalopathy (Deli Dana Hastalığı), Alzheimer hastalığı ve Parkinson hastalığı gibi amiloid hastalıkları Anfinsen'in dogmasının istisnalarıdır.
S: Christian Anfinsen Nobel Ödülünü nasıl kazandı?
C: Christian Anfinsen Nobel Kimya Ödülünü ribonükleaz A enziminin yapısı üzerine yaptığı çalışmayla kazanmıştır.
S: Prionların doğal katlanma durumundan farkı nedir?
C: Prionlar, doğal katlanma durumundan farklı olan proteinlerin kararlı konformasyonlarıdır.
