Amerikan İç Savaşı'nda Kaliforniya, altının doğuya gönderilmesinde, Batı Birleşik Devletler'deki düzenli ordu güçlerinin yerini alacak gönüllü askerlerin toplanmasında ve çok sayıda kamp ve tahkimatın bakımı ve inşasında yer aldı. Kaliforniya Eyaleti birliklerini doğuya göndermedi, ancak birçok vatandaş doğuya seyahat ederek Birlik Ordusuna katıldı. Kaliforniya Gönüllüleri ayrıca eyalet içinde ve Pasifik ve New Mexico Departmanlarının diğer Batı bölgelerinde Kızılderili halklara karşı birçok operasyon yürüttü.
Altına Hücum'un ardından Kaliforniya'ya öncelikle Ortabatı ve Güneyli çiftçiler, madenciler ve işadamları yerleşti. Eyalete kuruluşundan itibaren Demokratlar hakim oldu. Güneyli Demokratlar, ayrılan Amerika Konfedere Devletleri'ne sempati duyuyorlardı, ancak eyalette azınlık bir gruptu. Kaliforniyalı işadamları, madenler, gemicilik, finans ve Cumhuriyetçi Parti üzerindeki kontrolleri sayesinde Kaliforniya siyasetinde önemli bir rol oynadılar. Ancak ayrılma krizine kadar azınlık bir partiydiler.