Siyanobakteriler fotosentez yapan bir bakteri taksonudur. Bir zamanlar mavi-yeşil alg olarak adlandırılmalarına rağmen alg değildirler. Yaklaşık 1500 türü olan bir bakteri filumudur. Endosimbiont teorisine göre, kloroplastlar (plastidler) siyanobakterilerden türemiştir. DNA profilleri bunun kanıtıdır.

Siyanobakteriler, en az 3.500 milyon yıl öncesinden başlayan son derece uzun bir fosil kaydına sahiptir. Arkean ve Proterozoik çağların stromatolitlerinde ana organizmalar olmuşlardır.

Siyanobakterilerin oksijenik fotosentez yapabilme kabiliyeti oldukça önemlidir. Dünya'daki ilk atmosfer büyük ölçüde indirgeyiciydi, yani oksijensizdi. Stromatolitlerdeki siyanobakteriler fotosentez yapan ve serbest oksijen üreten bilinen ilk organizmalardır. Yaklaşık bir milyar yıl sonra, bu fotosentezin etkisiyle atmosferde büyük bir değişim başladı. Büyük Oksijenlenme Olayı olarak adlandırılan bu süreç uzun zaman aldı. Sonunda, oksijen içinde yaşayamayan organizmaların çoğunu öldürdü ve bugün bildiğimiz, çoğu organizmanın oksijen kullandığı ve oksijene ihtiyaç duyduğu ortam türlerine yol açtı.