Bakteriyel konjugasyon, genetik materyalin doğrudan hücreden hücreye temas yoluyla veya iki hücre arasında köprü benzeri bir bağlantı yoluyla bakteri hücreleri arasında aktarılmasıdır.
Konjugasyon, transformasyon ve transdüksiyon gibi bir yatay gen transferi mekanizmasıdır, ancak bu diğer iki mekanizma hücreden hücreye temas içermez.
Bakteriyel konjugasyon, Nobel Ödülü sahibi Joshua Lederberg ve Edward Tatum tarafından keşfedilmiştir. Escherichia coli bakterisinin genetik bilgiyi paylaşabildiği cinsel bir evreye girdiğini gösterdiler.
Bakteriyel konjugasyon, genetik materyal değişimini içerdiği için genellikle yanlış bir şekilde eşeyli üremeye eşdeğer olarak kabul edilir. Konjugasyon sırasında donör hücre, çoğunlukla bir plazmid veya transpozon olan konjugatif veya mobilize edilebilir bir genetik unsur sağlar. Çoğu konjugatif plazmid, alıcı hücrenin halihazırda benzer bir element içermemesini sağlayan sistemlere sahiptir.
Aktarılan genetik bilgi genellikle alıcı için faydalıdır. Faydalar arasında antibiyotik direnci, ksenobiyotik toleransı veya yeni metabolitleri kullanma yeteneği sayılabilir. Bu tür faydalı plazmidler bakteriyel endosimbiontlar olarak kabul edilebilir. Ancak diğer unsurlar bakteriyel parazitler olarak görülebilir ve konjugasyon, yayılmalarına izin vermek için onlar tarafından geliştirilen bir mekanizma olarak görülebilir.

