Kodlamayan DNA dizileri, bir organizmanın DNA'sının protein dizilerini kodlamayan kısımlarıdır.
Bazı kodlamayan DNA'lar işlevsel kodlamayan RNA moleküllerine (örneğin transfer RNA, ribozomal RNA ve düzenleyici RNA'lar) transkribe edilirken, diğerleri transkribe edilmez veya işlevi bilinmeyen RNA transkriptlerine yol açar. Kodlamayan DNA miktarı türler arasında büyük farklılıklar gösterir. Örneğin, insan genomunun %98'inden fazlası kodlamayan DNA iken, tipik bir bakteri genomunun yalnızca yaklaşık %2'si kodlamayan DNA'dır.
Başlangıçta, kodlamayan DNA'nın büyük bir kısmının bilinen bir biyolojik işlevi yoktu. Özellikle basında "gereksiz DNA" olarak biliniyordu. Ancak, kodlama yapmayan birçok dizinin işlevsel olduğu yıllardır bilinmektedir. Bunlar arasında işlevsel RNA molekülleri için genler ve "replikasyonu başlat" sinyalleri, sentromerler ve telomerler gibi DNA dizileri bulunmaktadır.
Diğer kodlamayan dizilerin muhtemel ancak henüz keşfedilmemiş işlevleri vardır. Bu, farklı DNA türlerinde görülen yüksek düzeydeki dizi benzerliğinden çıkarılmaktadır.
DNA Elementleri Ansiklopedisi (ENCODE) projesi Eylül 2012'de insan genomundaki DNA'nın %80'inden fazlasının "biyokimyasal olarak bir amaca hizmet ettiğini" öne sürmüştür. Bu sonuç diğer bazı bilim insanları tarafından şiddetle eleştirilmiştir.

