Kütle ve bileşim
Neptün'ün kütlesi 10,243×10 25kg olup, gezegeni Dünya ile en büyük gaz devleri arasına yerleştirir; Neptün on yedi Dünya kütlesine sahiptir ancak Jüpiter'in kütlesinin sadece 1/18'i kadardır. Neptün ve Uranüs, Jüpiter ve Satürn'e kıyasla daha küçük boyutları ve bileşimlerindeki büyük farklılıklar göz önüne alındığında, genellikle "buz devleri" olarak bilinen bir gaz devi alt sınıfının parçası olarak kabul edilir. Güneş dışı gezegenlerin araştırılmasında Neptün, keşfedilen gezegenin boyutunu ve yapısını belirlemek için bir referans olarak kullanılmıştır. Neptün gibi benzer kütlelere sahip keşfedilen bazı gezegenlere genellikle "Neptün" adı verilir. tıpkı gökbilimcilerin çeşitli güneş dışı "Jüpiter "lere atıfta bulunması gibi.
Neptün'ün atmosferi çoğunlukla hidrojen ve daha az miktarda helyumdan oluşur. Atmosferde az miktarda metan da tespit edilmiştir. Metanın önemli soğurma bantları 600 nm'nin üzerindeki dalga boylarında, spektrumun kırmızı ve kızılötesi kısmında gerçekleşir. Atmosferik metan tarafından kırmızı ışığın emilmesi Neptün'e mavi rengini verir.
Neptün Güneş'ten çok uzaktaki yörüngesinde döndüğü için, atmosferin en üst bölgeleri -218 °C (55 K) ile çok az ısı alır. Ancak gaz katmanlarının derinliklerinde sıcaklık yavaşça yükselir. Uranüs gibi, bu ısınmanın kaynağı bilinmemektedir, ancak farklar daha büyüktür: Neptün Güneş'ten en uzak gezegendir, ancak iç enerjisi Güneş Sistemi'nde görülen en hızlı rüzgarları yaratacak kadar güçlüdür. Gezegenin çekirdeğinden gelen radyojenik ısınma, gezegenin doğumu sırasında infalling madde tarafından üretilen artık ısının uzaya devam eden radyasyonu ve tropopozun üzerinde kırılan yerçekimi dalgaları dahil olmak üzere birkaç olası açıklama önerilmiştir.
Neptün'ün iç yapısının Uranüs'ün iç yapısına çok benzediği düşünülmektedir. Yaklaşık 15 Dünya kütlesinde olduğu düşünülen ve kaya, su, amonyak ve metan karışımıyla çevrili erimiş kaya ve metalden oluşan bir çekirdek olması muhtemeldir. Ağır basınçlar, çekirdeğin yakınındaki yüksek sıcaklıklara rağmen, bu çevreleyen karışımın buzlu kısmını katı halde tutmaktadır. Merkeze doğru yolun yaklaşık %10 ila 20'si kadar uzanan atmosfer, yüksek irtifalarda çoğunlukla hidrojen ve helyumdan oluşur. Atmosferin alt bölgelerinde daha çok metan, amonyak ve su karışımları bulunur. Çok yavaş bir şekilde bu daha karanlık ve sıcak bölge aşırı ısınmış sıvı iç kısma karışır. Neptün'ün merkezindeki basınç, Dünya yüzeyindekinden milyonlarca kat daha fazladır. Dönme hızı ile oblatlık derecesi karşılaştırıldığında, Uranüs'ün aksine kütlesinin merkeze doğru daha az yoğunlaştığı görülür.
Hava durumu ve manyetik alan
Neptün ve Uranüs arasındaki bir fark, gözlemlenen (görülen veya ölçülen) meteorolojik aktivite seviyesidir. Voyager uzay aracı 1986 yılında Uranüs'ün yanından geçtiğinde, gezegendeki rüzgarların hafif olduğu gözlemlenmiştir. Voyager 1989 yılında Neptün'ün yanından geçtiğinde ise güçlü hava olayları gözlemlenmiştir. Neptün'ün hava durumu son derece aktif fırtına sistemlerine sahiptir. Atmosferi, güneş sistemindeki en yüksek rüzgar hızlarına sahiptir ve bunun iç ısı akışından kaynaklandığı düşünülmektedir. Ekvator bölgesindeki düzenli rüzgarlar yaklaşık 1.200 km/saat (750 mil/saat) hıza sahipken, fırtına sistemlerindeki rüzgarlar süpersonik hıza yakın 2.100 km/saate kadar ulaşabilir.
1989 yılında, Avrasya büyüklüğünde siklonik bir fırtına sistemi olan Büyük Karanlık Leke, NASA'nın Voyager 2 uzay aracı tarafından keşfedildi. Fırtına Jüpiter'deki Büyük Kırmızı Leke'ye benziyordu. Ancak 2 Kasım 1994'te Hubble Uzay Teleskobu gezegendeki Büyük Karanlık Leke'yi görmedi. Bunun yerine, gezegenin kuzey yarımküresinde Büyük Karanlık Leke'ye benzer yeni bir fırtına bulundu. Büyük Karanlık Leke'nin neden kaybolduğu bilinmemektedir. Olası teorilerden biri, gezegenin çekirdeğinden gelen ısı transferinin atmosferik dengeyi ve mevcut dolaşım modellerini bozmuş olmasıdır. Scooter, Büyük Karanlık Leke'den daha güneyde yer alan bir başka fırtına, beyaz bir bulut grubudur. Takma adı 1989'da Voyager'ın karşılaşmasından önceki aylarda ilk kez fark edildiğinde verilmiştir: Büyük Karanlık Leke'den daha hızlı hareket etmektedir. Daha sonraki görüntüler Scooter'dan bile daha hızlı hareket eden bulutlar göstermiştir. Sihirbazın Gözü/Karanlık Leke 2 bir başka güney siklonik fırtınasıdır ve 1989'daki karşılaşma sırasında görülen en güçlü ikinci fırtınadır. Başlangıçta tamamen karanlıktı, ancak Voyager gezegene yaklaştıkça parlak bir çekirdek gelişti ve en yüksek çözünürlüklü görüntülerin çoğunda görüldü.
Diğer gaz devlerinin aksine, Neptün'ün atmosferi aşağıda kalın bir bulut tabakası üzerinde gölgeler oluşturan yüksek bulutların varlığını göstermektedir. Neptün'ün atmosferi Uranüs'ünkinden çok daha aktif olsa da, her iki gezegen de aynı gaz ve buzlardan oluşur. Uranüs ve Neptün, Jüpiter ve Satürn gibi tam olarak aynı tür gaz devleri değil, daha ziyade buz devleridir, yani daha büyük bir katı çekirdeğe sahiptirler ve aynı zamanda buzlardan yapılmıştırlar. Neptün çok soğuktur ve 1989 yılında bulut tepelerinde -224 °C (-372 °F veya 49 K) kadar düşük sıcaklıklar kaydedilmiştir.
Neptün'ün manyetosferi de Uranüs'le benzerlik göstermektedir; manyetik alanı dönme eksenine göre 47°'lik bir eğime sahiptir ve gezegenin fiziksel merkezinden en az 0,55 yarıçap (yaklaşık 13.500 kilometre) uzaktadır. İki gezegenin manyetik alanlarını karşılaştıran bilim insanları, bu aşırı seyrin Uranüs'ün yana doğru dönme hareketinin bir sonucu değil, gezegenin iç kısmındaki akışların bir özelliği olabileceğini düşünüyor. []