1791'den itibaren federal hükümet damıtılmış içecekler, tütün, şeker, şirket tahvilleri ve köleler üzerinden alınan vergilerle desteklendi. Bunlar, Birleşik Devletler Anayasası'nın izin verdiği tek tür olan dolaylı vergilerdi. 1812'de savaşın maliyeti altın, mücevher ve gümüş eşyalar üzerindeki ilk satış vergilerini ekledi. 1817'de hükümet tüm bu vergileri kaldırdı ve ithal mallar üzerindeki tarifelerden elde edilen fonlara güvendi.
Amerikan İç Savaşı sırasında, savaşı finanse etmek için fonlara ihtiyaç vardı. Kongre 1861 yılında kişisel ve kurumsal gelirler üzerinden doğrudan vergi alınması için bir yasa tasarısı hazırladı. Bu ilk gelir vergisi 800 doların üzerindeki gelirlerden %3 oranında alınıyordu. Tasarı Kongre'nin her iki kanadından da geçti ancak hiçbir zaman yürürlüğe girmedi. Ancak 1862'de Abraham Lincoln, 600 ila 5.000 dolar arasındaki gelirlerden %3, 5.000 ila 10.000 dolar arasındaki gelirlerden %7,5 ve 10.000 doların üzerindeki gelirlerden %10 vergi alınmasını öngören bir tasarıyı imzaladı. Kongre'de doğrudan gelir vergisinin anayasaya uygunluğu konusunda tartışmalar yaşandı, ancak herhangi bir adım atılmadı. Yenilenmesi gündeme geldiğinde 1872 yılında sona ermesine izin verildi.
1862 yılında Kongre, İç Gelir Komiserliği makamını yetkilendirmişti. Bugün olduğu gibi, vergi takdir etme, koyma ve toplama yetkisine sahipti. Ayrıca vergi kanunlarını kovuşturma ve mülk ve gelirlere el koyma yoluyla uygulama hakkına da sahipti. George S. Boutwell, İç Gelir Bürosu'nun ilk komiseriydi. / 1894 yılında Kongre Wilson-Gorman Tarifesini kabul etti. Bu tarife Amerika Birleşik Devletleri'ne yapılan bazı ithalatlarda gümrük vergilerini düşürüyordu. Ancak bunu %2 oranında doğrudan gelir vergisi alarak telafi etti. Yüksek Mahkeme, Pollock v. Farmers' Loan & Trust Co davasında bir yıl sonra gelir vergisinin anayasaya aykırı olduğuna karar verdi. Mahkeme, Anayasa'nın eyaletler arasında paylaştırılmadan gelir vergisi alınmasına izin vermediğine hükmetti.
3 Şubat 1913 tarihinde Birleşik Devletler Anayasası'nın On Altıncı Değişikliği onaylandı. Kritik bölüşüm sorunundan arındırılmış olan bu değişiklik, Kongre'nin gelir vergisi uygulamasına izin veriyordu. IRS Bürosu gelir vergilerini toplamakla görevlendirildi. Kişisel gelir vergisi 3.000 doların üzerindeki gelirler için %1'di. 5.000 doların üzerindeki gelirler %6 ek vergiye tabiydi. Gelir vergileri 1918'de I. Dünya Savaşı'nın finansmanına yardımcı olmak için %77'ye kadar yükseldi. 1929'da %24'e kadar düştü ancak 1929'daki Büyük Buhran sırasında tekrar yükseldi. İkinci Dünya Savaşı sırasında stopaj ve üç aylık vergiler getirilmiştir.
1953 yılında İç Gelir Bürosu yeniden örgütlendi ve adını İç Gelir Servisi olarak değiştirdi.
1998 yılında IRS Yeniden Yapılandırma ve Reform Yasası kurumu yeniden organize etmiş ve modernize etmiştir. Vergi mükelleflerinin hakları daha da genişletildi.
Şu anki İç Gelir Komiseri Charles P. Rettig'dir.