Mont-Saint-Michel, altıncı ve yedinci yüzyıllarda Gallo-Roma kültürünün Zırhlı bir kalesiydi. Yedinci yüzyılda Franklar dağı ele geçirmiştir. Yaklaşık beşinci yüzyıldan sekizinci yüzyıla kadar Mont-Saint-Michel, Neustria adı verilen bölgenin bir parçasıydı. Dokuzuncu yüzyılın başlarında, Neustria'nın marşlarında önemli bir yerdi.
Sekizinci yüzyıldan önce adanın adı Mont Tombe (Latince: tumba) idi. Katolik Kilisesi sekizinci yüzyılda ilk dini yapıyı inşa etmiş ve dağ Mont-Saint-Michel adını almıştır. Efsaneye göre, Başmelek Mikail 708 yılında Avranches piskoposu Aziz Aubert'e görünmüştür. Melek ona dağda bir kilise inşa etmesini söylemiştir. Aubert, Mikail parmağıyla piskoposun kafatasında bir delik açana kadar meleği dinlememiştir.
Frankların kralı, krallığını Vikinglerin saldırılarına karşı savunamadı. Kral, 867 Compiègne Antlaşması'nda Mont-Saint-Michel de dahil olmak üzere Cotentin yarımadasını ve Avranchin'i Bretonlara vermeyi kabul etti. Dağ kısa bir süre için Bretonlara ait oldu. Aslında bu topraklar ve Mont-Saint-Michel hiçbir zaman Bretanya dükalığına ait olmamıştır. Yeni oluşturulan Breton başpiskoposluğu Dol'dan ayrı piskoposluklar olarak kaldılar. Rollo, Franco'yu Rouen başpiskoposu olarak atadığında, Rouen piskoposluğu toprakları ve dağı aldı. Bir kez daha Normandiya'nın bir parçası oldular ama resmi olarak değil.
Dağ, 933 yılında "Uzun Kılıç" William'ın (Normandiya Dükü) Cotentin Yarımadası'nı zayıflamış Bretanya Dükleri'nden almasıyla stratejik açıdan yeniden önem kazanmıştır. Bu, dağı resmi olarak Normandiya'nın bir parçası haline getirdi. Bu durum, Normanların 1066'da İngiltere'yi fethini anan (hatırlanmasına yardımcı olan) Bayeux Tapestry'de gösterilmiştir. Goblende Wessex Kontu Harold, Bretanya Dükü Conan II ile yapılan bir savaş sırasında Mont-Saint-Michel çevresindeki bataklıktan iki Norman şövalyesine yardım ederken gösterilmektedir. Sonraki yüzyıllarda manastırın geliştirilmesi için Norman dükleri ödeme yapmıştır. Norman mimarisinin iyi bir örneği haline gelmiştir.
1067 yılında Mont-Saint-Michel Manastırı, Normandiya Dükü William'a İngiltere tahtında hak iddia etmesi için destek vermiştir. William ödül olarak Manş Denizi'nin İngiliz tarafında evler ve araziler verdi. Bunlar arasında Cornwall'un güneybatı kıyısındaki küçük bir ada da vardı. Burası St Michael's Mount of Penzance adında bir Norman manastırına dönüştü. Mont-Saint-Michel'e benzemektedir.
Yüz Yıl Savaşları sırasında İngilizler adaya pek çok saldırı düzenlemiştir. Manastırın çok iyi tahkimatı nedeniyle adayı ele geçiremediler. İngilizler dağa ilk olarak 1423'te ve ardından 1433'te tekrar saldırdı. Thomas Scalles İngiliz ordusunun lideriydi. Scalles saldırısını durdurduğunda iki ferforje bombardıman topu bıraktı. Bugün hala oradalar. Bunlar les Michelettes olarak bilinmektedir. Mont-Saint-Michel'deki direniş Fransızlara, özellikle de Joan of Arc'a umut vermiştir.
Fransa Kralı XI Louis 1469 yılında Aziz Mikail Tarikatı'nı kurduğunda, Mont-Saint-Michel kilisesinin tarikatın şapeli olmasını istemiştir. Ancak Paris'ten uzak olduğu için bu mümkün olmadı.
Manastırın zenginliği ve etkisi, Cornwall'daki St Michael's Mount gibi diğer vakıflara da yardımcı olmuştur. Ancak, Reformasyon nedeniyle bir hac merkezi olarak daha az popüler olmaya başlamıştır. Fransız Devrimi sırasında burada neredeyse hiç keşiş yaşamıyordu. Cumhuriyetçiler manastırı kapattı. Bir hapishane haline geldi. İlk başta Fransız cumhuriyetinin din düşmanları burada tutuluyordu. Daha sonra, dağda önemli siyasi mahkumlar da vardı. 1836'da Victor Hugo gibi ünlü isimler dağın restore edilmesi için bir kampanya başlattı. Hapishane 1863 yılında kapatıldı ve dağ 1874 yılında tarihi bir anıt haline geldi. Mont-Saint-Michel ve körfezi 1979 yılında UNESCO Dünya Mirası Listesi'ne girmiştir. Listeleme faktörleri arasında kültürel, tarihi ve mimari önemin yanı sıra insan yapımı ve doğal güzellikler de yer almıştır.
Manastır tasarımı
11. yüzyılda Normandiyalı Richard II, Mont-Saint-Michel manastırını inşa etmesi için William de Volpiano adında bir İtalyan mimarı seçmiştir. Volpiano daha önce Normandiya'da Fécamp Manastırı'nı inşa etmişti. Manastırın Romanesk kilisesini tasarlamıştır. Transept geçişini dağın tepesine yerleştirmeyi seçti. Ayrıca yerin altına çok sayıda mahzen ve şapel inşa etmiştir. Bunlar yukarıdaki binayı desteklemek içindir, çünkü çok ağırdır. Bugün Mont-Saint-Michel'de Romanesk tarzda bir kilise bulunmaktadır.
Robert de Thorigny, İngiltere Kralı 2. Henry'nin büyük bir destekçisiydi. Henry aynı zamanda Normandiya Dükü'ydü. Thorigny binaların yapısını daha güçlü hale getirdi. Ayrıca 12. yüzyılda kilisenin ana cephesini de inşa etmiştir. 1204 yılında Fransa Kralı'nın dostu olan Breton Guy de Thouars bir orduyla dağa saldırdı. Köyü ateşe verdi ve çok sayıda insanı öldürdü. Ancak manastırın güçlü duvarları altında geri çekilmek (terk etmek) zorunda kaldı. Yangın binalara da sıçradı ve çatılar yandı. Thorigny'nin arkadaşı Philip Augustus, zalimce eylemlerden ve yıkımdan dolayı mutsuzdu. Başrahip Jourdain'e Gotik tarzda yeni bir mimari set inşa etmesi için biraz para teklif etti. Başrahip yemekhaneyi ve manastırı ekledi.
Charles manastır dağına büyük tahkimatlar ekledi. Ayrıca kuleler ve avlular inşa etti ve surları daha güçlü hale getirdi.
Geliştirme
· 
· 
11. yüzyıldan 12. yüzyıla
· 
17. yüzyıldan 18. yüzyıla
· 
19. yüzyıldan 20. yüzyıla