İşlevi olmayan özellikler
Bir organizmanın tüm özellikleri adaptasyon değildir. Türün yaşamında bir işlevi olup olmadığını öğrenmek için saha araştırmaları veya deneyler gerekebilir.
Adaptasyonlar, bir türün geçmiş yaşamını yansıtma eğilimindedir. Eğer bir tür yakın zamanda yaşam tarzını değiştirmişse, bir zamanlar değerli olan bir adaptasyon, giderek azalan bir kalıntı haline gelebilir. Karanlık mağaralarda yaşayan hayvanlar genellikle uzun bir süre içinde renklerini ve görme yetilerini kaybederler.
Bunun nedenleri değişiklik gösterebilir. Yapı ve işlev kaybı, enerji ve malzeme tasarrufu sağlayan olumlu bir adaptasyon olabilir. Ancak diğer işlevler için seçilen genlerin bir yan ürünü de olabilir (pleiotropi). Ya da yapı gelişimle bağlantılı olabilir ve başka bir yapı için seçilimden etkilenebilir.
Artık işe yaramayan adaptasyonların ya körelmiş organlar haline gelmesi (bkz. vermiform apandis) ya da seçilerek başka işlevlere adapte edilmesi (bkz. kulak kemikçikleri) genel bir kuraldır.
Çoklu işlevlere sahip adaptasyonlar
Birçok adaptasyon birden fazla işleve hizmet eder. Bazı özelliklerin neredeyse ilgili türü tanımlayacak kadar belirgin hale gelmesinin nedeni genellikle budur. Bir atın bacakları da ana savunmadır: bir atın tekmesi çok yıkıcıdır. Erkek geyiklerin boynuzları, yırtıcılara karşı savunmanın yanı sıra cinsel bir işleve de hizmet eder. İnsanın büyük beyni sadece dil için değil, aynı zamanda düşünme ve problem çözme için de hizmet eder. Kuş tüyleri sadece uçmak için kullanılmaz; ısı korunumu, ısı düzenlemesi ve sinyalizasyonun temelini oluşturur.
Uyarlamalar arasında uzlaşma ve çatışma
Doğanın en iyisini bilmediği derin bir gerçektir; genetik evrim... bir israf, eğretilik, uzlaşma ve gaf hikayesidir. Peter Medawar.
Uyarlamalar asla mükemmel değildir. Bir vücuttaki çeşitli işlevler ve yapılar arasında her zaman ödünleşimler vardır. Yaşayan ve üreyen bir bütün olarak organizmadır, bu nedenle gelecek nesillere aktarılan adaptasyonların tamamıdır.
Tüm adaptasyonların bir dezavantajı vardır: at bacakları çimlerde koşmak için harikadır, ancak sırtlarını kaşıyamazlar; memelilerin tüyleri ısı düzenlemesine yardımcı olur, ancak ektoparazitler için bir niş sunar. Uzlaşma ve eğreti durma yaygın olarak görülür, mükemmellik değil. Seçilim baskıları farklı yönlere çeker ve sonuçta ortaya çıkan adaptasyon bir tür uzlaşmadır.
Bir bütün olarak fenotip seçimin hedefi olduğundan, fenotipin tüm yönlerini aynı anda aynı derecede iyileştirmek imkansızdır. Ernst Mayr.p589
Tavus Kuşları
Tespit edilmekten kaçınmak için kullanılan kamuflaj, çiftleşme zamanında canlı renkler sergilendiğinde yok olur. Burada yaşam riski üreme ihtiyacı ile dengelenir. Tavus kuşunun süs treni (her çiftleşme mevsimi için yeniden yetiştirilir) ünlü bir adaptasyondur. Manevra kabiliyetini ve uçuşunu azaltması gerekir ve son derece dikkat çekicidir; ayrıca büyümesi besin kaynaklarına mal olur.
Darwin bu avantajı cinsel seçilimle açıklamıştır: "Üreme ile ilgili olarak belirli bireylerin aynı cinsiyet ve türden diğer bireyler üzerinde sahip olduğu avantaja bağlıdır". Tavuskuşu tarafından temsil edilen cinsel seçilim türüne 'eş seçimi' denir, yani süreç daha uygun olanı daha az uygun olana göre seçer ve bu nedenle hayatta kalma değeri vardır. Pratikte, mavi tavus kuşu Pavo cristatus, Hindistan'da geniş bir doğal alana sahip oldukça başarılı bir türdür, bu nedenle çiftleşme sistemlerinin genel sonucu oldukça uygulanabilirdir.
İnsan doğumu
İnsan cenin beyninin doğumdaki boyutu, yeni doğan bir çocuğun beyninin oldukça olgunlaşmamış olduğu anlamına gelir. Yeni doğanın beyni yaklaşık 400cc'den daha büyük olamaz, aksi takdirde annenin pelvisinden geçemez. Oysa yetişkin bir beyin için gereken boyut yaklaşık 1400cc'dir.
İnsan hayatındaki en önemli şeyler (hareket, konuşma) beyin büyüyüp olgunlaşana kadar beklemek zorundadır. Bu, doğum uzlaşmasının sonucudur. Sorunun büyük bir kısmı, pelvisimizin doğum için daha uygun bir şekilde şekillendirilebileceği dik iki ayaklı duruşumuzdan kaynaklanmaktadır. Neandertallerde de benzer bir sorun vardı.
Zaman içinde fonksiyon değişimi
Bir özelliğin işlevi zaman içinde değişebilir ve genellikle de değişir. Bunu tanımlamak için çeşitli terimler kullanılmıştır: ön adaptasyon, exaptasyon, kooptasyon. 'Preadaptasyon', bir atadan miras kalan önceden var olan bir yapı veya özellik farklı bir işlev geliştirdiğinde kullanılan en yaygın terimdir. Bu terim Julian Huxley ve Ernst Mayr tarafından kullanılmıştır. 'Önceden' terimi herhangi bir öngörü anlamına gelmez, sadece adaptasyonun zaten mevcut olduğu ve daha eski bir işleve hizmet ettiği anlamına gelir. 'Uyum sağlama' Stephen J. Gould'un sözcüğüydü.
Ön adaptasyonun bir örneği, ilk kuşlar tarafından uçuş için kullanılmadan çok önce ısı yalıtımı ve sergileme işlevine sahip tüyler geliştiren dinozorlarda görülmektedir. Memelilerdeki ter bezleri daha sonra meme bezlerine dönüşmüştür. Bir başka örnek de, eski balıkların solungaç kapaklarında başlayan, daha sonra sürüngenlerin alt çenesinin bir parçası olan ve daha sonra memelilerin iç kulağının bir parçası haline gelen memeli kulak kemikçiklerinin uzun yolculuğudur. Bir başka örnek de penguenlerin kanatlarıdır. Bir zamanlar uçmak için kullanılan kanatlar, artık su altında 'uçmak' için kullanılmaktadır.
Organlarda ve yapılarda işlev değişikliği evrimde son derece yaygındır. Tetrapodların (kara omurgalıları) birçok özelliği, ataları olan lob yüzgeçli balıklardaki (Sarcopterygii) farklı işlevlere sahip özelliklerden evrimleşmiştir.