Bir kütle spektrometresi tipik olarak iki yoldan biriyle kullanılır: Tam Tarama veya Seçici İyon İzleme (SIM). Tipik bir GC-MS her iki şekilde de tek başına ya da her ikisi de aynı anda çalışabilir.
Tam tarama MS
Tam tarama modunda veri toplarken, hedef bir kütle parçası aralığı seçilir ve cihazın yöntemine yerleştirilir. İzlenecek tipik bir geniş kütle parçası aralığına örnek olarak m/z 50 ila m/z 400 verilebilir. Hangi aralığın kullanılacağının belirlenmesi, büyük ölçüde çözücü ve diğer olası girişimlerin farkında olunurken numunede ne beklendiğine göre belirlenir. Bir MS çok düşük m/z değerine sahip kütle parçalarını ararsa, havayı veya diğer olası girişim faktörlerini tespit edebilir. Geniş bir tarama aralığı kullanmak cihazın hassasiyetini azaltır. Makine saniyede daha az tarama yapacaktır çünkü her tarama daha geniş bir kütle parçası aralığını tespit etmek için daha fazla zaman alacaktır.
Tam tarama, bir numunedeki bilinmeyen bileşiklerin belirlenmesinde faydalıdır. Bir numunedeki bileşiklerin doğrulanması veya çözülmesi söz konusu olduğunda SIM'den daha fazla bilgi sağlar. Çoğu cihaz, "cihaz yöntemi" adı verilen bir bilgisayar programını çalıştıran bir bilgisayar tarafından kontrol edilir. Cihaz yöntemi GC'deki sıcaklığı, MS tarama hızını ve tespit edilen parça büyüklükleri aralığını kontrol eder. Bir kimyager bir cihaz metodu geliştirirken, test çözeltilerini GS-MS'ye tam tarama modunda gönderir. Bu, bir SIM cihaz metoduna geçmeden önce GC alıkonma süresini ve kütle fragman parmak izini kontrol eder. Patlayıcı dedektörleri gibi özel GC-MS cihazlarına fabrikada önceden yüklenmiş bir cihaz yöntemi vardır.
Seçilmiş iyon izleme
Seçilmiş iyon izlemede (SIM), cihaz yöntemi belirli iyon parçalarına odaklanır. Kütle spektrometresi tarafından yalnızca bu kütle parçaları tespit edilir. SIM'in avantajları, cihaz her tarama sırasında yalnızca az sayıda parçaya (örneğin üç parça) baktığından tespit limitinin daha düşük olmasıdır. Her saniye daha fazla tarama gerçekleştirilebilir. İlgilenilen sadece birkaç kütle parçası izlendiğinden, matris girişimleri tipik olarak daha düşüktür. Pozitif bir sonucu doğru okuma şansını artırmak için, çeşitli kütle parçalarının iyon oranları bilinen bir referans standardıyla karşılaştırılabilir.
İyonizasyon türleri
Moleküller kolon boyunca ilerledikten, transfer hattından geçtikten ve kütle spektrometresine girdikten sonra çeşitli yöntemlerle iyonize edilirler. Tipik olarak herhangi bir zamanda sadece bir iyonizasyon yöntemi kullanılır. Numune parçalandıktan sonra genellikle bir elektron çarpan diyot tarafından tespit edilir. Diyot, iyonize kütle parçasını daha sonra algılanan bir elektrik sinyali gibi ele alır.
Kimyagerler, Tam Tarama veya SIM izleme seçiminden ayrı olarak bir iyonizasyon tekniği seçerler.
Elektron iyonizasyonu
En yaygın iyonizasyon türü elektron iyonizasyonudur (EI). Moleküller MS'ye girer (kaynak bir kuadrupol veya iyon tuzaklı MS'de iyon tuzağının kendisidir) ve burada bir filamentten yayılan serbest elektronlarla çarpılırlar. Bu, standart bir akkor ampulde bulunan filamana benzer. Elektronlar moleküllere çarparak molekülün tekrarlanabilen karakteristik bir şekilde parçalanmasına neden olur. Bu "sert iyonizasyon" tekniği, düşük kütle/yük oranına (m/z) sahip daha fazla parçanın oluşmasıyla sonuçlanır. EI, orijinal molekülün kütlesine yakın bir kütleye sahip çok az sayıda parçaya sahiptir. Kimyacılar sert iyonizasyonun örnek moleküllere elektron fırlatmak olduğunu düşünmektedir. Buna karşılık, "yumuşak iyonizasyon", örnek molekülüne verilen bir gazla vurarak üzerine bir yük yerleştirmektir. Moleküler parçalanma modeli, sisteme uygulanan elektron enerjisine bağlıdır, tipik olarak 70 eV (elektron Volt). 70 eV kullanımı, test numunesinden üretilen spektrumların bilinen kütüphane spektrumlarıyla karşılaştırılmasına yardımcı olur. (Kütüphane spektrumları üretici tarafından sağlanan yazılımdan veya Ulusal Standartlar Enstitüsü (NIST-ABD) tarafından geliştirilen yazılımdan gelebilir). Yazılım, Olasılık Tabanlı Eşleştirme veya nokta-çarpım eşleştirme gibi bir eşleştirme algoritması kullanarak kütüphane spektrumlarını arar. Birçok yöntem standardizasyon ajansı artık tarafsızlıklarını sağlamak için bu algoritmaları ve yöntemleri kontrol etmektedir.
Kimyasal iyonizasyon
Kimyasal iyonizasyonda (CI), kütle spektrometresine tipik olarak metan veya amonyak gibi bir reaktif gaz konur. İki tür CI vardır: pozitif CI veya negatif CI. Her iki durumda da, reaktif gaz elektronlar ve analit ile etkileşime girecek ve ilgili molekülün 'yumuşak' iyonlaşmasına neden olacaktır. Daha yumuşak bir iyonizasyon, molekülü EI'nin sert iyonizasyonundan daha düşük bir dereceye kadar parçalar. Kimyagerler EI yerine CI'yi tercih ederler. Bunun nedeni, CI'nin ilgili analitin moleküler ağırlığıyla neredeyse aynı ağırlığa sahip en az bir kütle parçası üretmesidir.
Pozitif Kimyasal İyonizasyon
Pozitif Kimyasal İyonizasyonda (PCI) reaktif gazı hedef molekülle, çoğunlukla bir proton değişimi ile etkileşime girer. Bu, iyon türlerini nispeten yüksek miktarlarda üretir.
Negatif Kimyasal İyonizasyon
Negatif Kimyasal İyonizasyonda (NCI) reaktif gaz, serbest elektronların hedef analit üzerindeki etkisini azaltır. Bu azalmış enerji tipik olarak parçayı büyük bir tedarik içinde bırakır. (Parçalar daha fazla parçalanmaz.)
Yorumlama
Cihaz analizinin birincil amacı bir madde miktarını ölçmektir. Bu, oluşturulan kütle spektrumundaki atomik kütleler arasındaki bağıl konsantrasyonların karşılaştırılmasıyla yapılır. Karşılaştırmalı ve orijinal olmak üzere iki tür analiz mümkündür. Karşılaştırmalı analiz temel olarak verilen spektrumu bir spektrum kütüphanesi ile karşılaştırarak özelliklerinin kütüphanedeki bilinen bir örnek için mevcut olup olmadığını görür. Bu en iyi bilgisayar tarafından gerçekleştirilir çünkü ölçekteki farklılıklar nedeniyle birçok görsel bozulma meydana gelebilir. Bilgisayarlar ayrıca belirli verileri daha doğru bir şekilde ilişkilendirmek için daha fazla veriyi (GC tarafından tanımlanan alıkonma süreleri gibi) ilişkilendirebilir.
Bir başka analiz yöntemi de tepe noktalarını birbirleriyle ilişkili olarak ölçer. Bu yöntemde en yüksek tepe noktası %100 olarak belirlenir. Diğer piklere, pik yüksekliğinin en yüksek pik yüksekliğine oranına eşit bir değer verilir. 3'ün üzerindeki tüm değerler atanır. Bilinmeyen bileşiğin toplam kütlesi normalde ana pik tarafından gösterilir. Bu ana pikin değeri, bileşikte bulunduğuna inanılan çeşitli elementleri içeren bir kimyasal formüle uydurmak için kullanılabilir. Spektrumdaki izotop deseni, birçok izotopa sahip elementler için benzersizdir. Dolayısıyla, mevcut çeşitli elementleri tanımlamak için de kullanılabilir. Bu, bilinmeyen molekülün genel kimyasal formülünü gösterir. Bir molekülün yapısı ve bağları karakteristik şekillerde parçalandığından, pik kütlelerindeki farktan tanımlanabilirler. Tanımlanan molekül yapısı, GC-MS tarafından kaydedilen özelliklerle tutarlı olmalıdır. Tipik olarak, bu tanımlama cihazla birlikte gelen bilgisayar programları tarafından otomatik olarak yapılır. Bu programlar spektrumları, numunede bulunabilecek aynı element listesine sahip bilinen bileşiklerden oluşan bir kütüphane ile eşleştirir.
"Tam spektrum" analizi, bir spektrum içindeki tüm "tepe noktalarını" dikkate alır. Ancak, seçici iyon izleme (SIM) yalnızca belirli bir maddeyle ilişkili seçilmiş pikleri izler. Kimyagerler, belirli bir alıkoyma süresinde, bir dizi iyonun belirli bir bileşiğin karakteristiği olduğunu varsayarlar. SIM hızlı ve verimli bir analizdir. SIM, analistin bir numune hakkında önceden bilgi sahibi olduğu veya yalnızca birkaç spesifik madde aradığı durumlarda en iyi sonucu verir. Belirli bir gaz kromatografik pikteki iyonlar hakkında toplanan bilgi miktarı azaldığında, analizin hassasiyeti artar. Dolayısıyla, SIM analizi bir bileşiğin daha küçük bir miktarının tespit edilmesine ve ölçülmesine olanak sağlar. Ancak bu bileşiğin kimliği hakkındaki kesinlik derecesi azalır.
GC-tandem MS
Kütle parçalanmasının ikinci bir aşaması eklendiğinde, örneğin bir kuadrupol cihazında ikinci bir kuadrupol kullanıldığında, buna tandem MS (MS/MS) denir. MS/MS, ilgilenilmeyen arka plan bileşiklerinden oluşan bir matrikse sahip bir numunedeki düşük seviyedeki hedef bileşikleri ölçmede iyidir.
İlk kuadrupol (Q1) bir çarpışma hücresi (q2) ve başka bir kuadrupol (Q3) ile bağlantılıdır. Her iki kuadrupol de kullanılan MS/MS analizinin türüne bağlı olarak tarama veya statik modda kullanılabilir. Analiz türleri arasında ürün iyonu taraması, öncü iyon taraması, Seçilmiş Reaksiyon İzleme (SRM) ve Nötr Kayıp Taraması yer alır. Örneğin: Q1 statik modda (SIM'de olduğu gibi sadece bir kütleye bakarak) ve Q3 tarama modunda olduğunda, ürün iyon spektrumu ("daughter spectrum" olarak da adlandırılır) elde edilir. Bu spektrumdan, seçilen öncü iyon için ürün iyonu olabilecek belirgin bir ürün iyonu seçilebilir. Bu çift "geçiş" olarak adlandırılır ve SRM için temel oluşturur. SRM son derece spesifiktir ve matris arka planını neredeyse tamamen ortadan kaldırır.